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來自上海交通大學醫學院的Jiahui Du,Yili Liu,Xiaolin Wu,Mingliang Zhou以及Xinquan Jiang 等多名研究人員在Nature Communications期刊(IF=16.6)上,共同發表了題為“BRD9-mediated chromatin remodeling suppresses osteoclastogenesis through negative feedback mechanism”的文章,在該文章中,研究人員使用了購自AbMole的 JQ1(M2167)和 Zoledronic acid(M5032)兩種產品,揭示了BRD9通過IFN-β信號介導的染色質重塑,對破骨細胞生成的負反饋調控機制,以及其應用于骨病研究的潛力。
含溴結構域蛋白9(BRD9)是非經典BAF染色質重塑復合物的一個組成部分,在髓系決定和巨噬細胞炎癥反應過程中至關重要。且破骨細胞起源于髓系,與造血系中的巨噬細胞有著共同的來源。但是目前對于BRD9在破骨細胞生成和骨病中的作用機制的了解仍然有限。
研究人員用M-CSF和RANKL培養BMDMs,發現在破骨細胞生成過程中,RANKL處理后BRD9的表達逐漸上調(圖1A-B)。隨后通過特異性地刪除BRD9來構建基因敲除小鼠(LysM-Cre;Brd9fl/fl小鼠)模型(圖1C)。μCT分析和組織學染色(圖1D-E)結果顯示,與對照組小鼠相比,LysM-Cre;Brd9fl/fl小鼠股骨骨小梁的骨量減少,礦化度下降。
進一步研究發現,突變體小鼠股骨骨面上來自LysM+髓系的螯合蛋白酶K(CTSK)+破骨細胞的細胞數量明顯增加,且雖然LysM-Cre;Brd9fl/fl小鼠和對照小鼠的成骨活性相當,但前者骨表面的侵蝕程度更高(圖2),說明Brd9消減后破骨細胞的譜系分化增強,骨吸收加快,從而導致骨量過度流失。
然后通過給小鼠的BMDMs注射RANKL,在體外誘導破骨細胞分化。研究人員發現,在RANKL誘導后,使用BRD9的抑制劑iBRD9處理的BMDMs中,破骨細胞特異性基因的表達增加(圖3A)。而在沒有RANKL誘導的情況下,iBRD9對破骨細胞生成沒有明顯影響,表明BRD9的功能依賴于RANKL(圖3B-C)。且RANKL處理后上調的BRD9以負反饋機制,抑制RANKL誘導的破骨細胞分化。
此外,研究人員發現,經iBRD9處理后,RANKL誘導的BMDMs中IFN-β信號活性下調(圖4A)。且在抑制BRD9的BMDMs中加入IFN-β1細胞因子后,可以抑制破骨細胞的生成(圖4B),提示BMDMs中IFN-β信號轉導的轉錄激活可能有助于BRD9介導的破骨細胞生成過程中的負反饋調節。
隨后,通過免疫沉淀(ChIP)測序,基因KEGG富集以及蛋白-蛋白相互作用(PPI)分析,研究人員發現STAT1是相互作用最多的樞紐基因之一,同時也是IFN-β信號活動的主要介質(圖5A-C)。且據觀察,Stat1缺陷小鼠的骨中存在過度的破骨細胞生成,表明其對破骨細胞分化具有負調控作用。進一步研究發現,Stat1表達下調可能是BRD9抑制破骨細胞過度生成的一個關鍵過程。
接下來研究人員將預測的Stat1近端啟動子和增強子克隆到載體中進行實驗,發現抑制BRD9能明顯降低Stat1啟動子和增強子的轉錄活性(圖6A)。且ChIP-qPCR結果顯示,BRD9可以直接與Stat1的啟動子和增強子結合(圖6B)。說明BRD9能通過直接調節Stat1的啟動子和增強子活性從而促進Stat1的轉錄。
隨后,通過分析ATAC-seq數據(圖7A)以及基因組中共定位情況,選擇轉錄因子FOXP1進行研究。免疫共沉淀(IP)分析證實,在破骨細胞分化期間,BMDMs中BRD9和FOXP1之間存在物理相互作用(圖7B)。ChIP-qPCR結果顯示,FOXP1可以直接與Stat1的啟動子和增強子結合,但在抑制BRD9后FOXP1與Stat1的結合功能會受到影響(圖7C)。提示FOXP1是BRD9在Stat1轉錄激活和破骨細胞分化過程中進行負反饋調節的關鍵輔助因子之一(圖7D)。
之后研究人員通過比較BRD9和BRD4被抑制后的轉錄譜,探索BRD9與BRD4的功能特異性,發現兩者的功能特異性主要存在于細胞周期和破骨細胞分化過程。
隨后又以脂多糖(LPS)誘導的牙槽骨損傷為模型進行實驗,發現Brd9缺失小鼠對牙槽骨的局部急性損傷(圖8A-B)和破骨細胞活性(圖8C-D)具有抗性。且含有BRD9降解劑的改良可注射光固化SF(圖8E)可以降低破骨細胞活性(圖8F-G)以及LPS/ligation刺激的急性局部骨質流失(圖8H-I)等指標。說明在感染刺激情況下,BRD9的缺失或降解在骨組織中的抗炎作用可能比在基礎條件下更為明顯。
該研究使用了購AbMole 的 JQ1(M2167)和Zoledronic acid(M5032)兩種產品。其中JQ1是BRD4的抑制劑,Zoledronic acid是一種可以抑制破骨細胞骨吸收,以及破骨細胞分化相關分子表達的化合物。
實驗中使用JQ1抑制BRD4,并與BRD9被dBRD9降解后的轉錄譜相比較。發現兩組差異最明顯的是細胞周期和破骨細胞分化過程。并且細胞周期相關的特征基因在JQ1組明顯下調(圖9),提示其在破骨細胞生成過程中的潛在作用導致了dBRD9和JQ1的相反效應。
研究人員通過使用Zoledronic acid建立頜骨壞死(ONJ)小鼠模型,并發明一種含有BRD9降解劑的改良型可注射光固化蠶絲纖維素(SF),在拔牙后立即填充到牙槽骨窩中。通過μCT成像評估顯示,ONJ-dBRD9組小鼠的臼齒拔除窩內充滿了組織良好的新形成的骨小梁(圖10A),且骨壞死和骨膜反應的發生率比ONJ-對照載體組的小鼠降低80%(圖10B)。表明應用dBRD9研究Zoledronic acid誘導的ONJ是一種有前景的策略。
綜上所述,研究人員揭示了BRD9-FOXP1-STAT1軸在破骨細胞負反饋途徑中的重要作用,進一步拓展對染色質重塑因子、轉錄因子以及信號通路之間互作網絡的認識,為開發破骨細胞相關骨病的研究策略提供了啟示。
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鳴謝:Du J, Liu Y, Wu X, et al. Nat Commun. 2023 Mar 14;14(1):1413.