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DNA磁珠純化技術的歷史和發展

瀏覽次數:876 發布日期:2024-5-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
DNA磁珠純化是一種簡單而可靠的DNA分離方法。
這種DNA純化方法有著廣泛的應用。事實上,基因組測序和分子分析已經成為生物研究中不可或缺的一部分,以至于現在它們幾乎是在高級期刊上發表工作的必要條件。
在科學研究之外,DNA磁珠純化也是刑事司法系統中法醫分析,以及臨床分子檢測基礎。這需要有能力從各種組織中快速提取和純化高質量的DNA和RNA。在這種需求的驅動下,DNA磁珠純化技術也得到了迅猛的發展。

DNA純化的歷史
自從Friederich Miescher在1869年進行了第一次DNA提取以來,我們對遺傳物質的了解已經大大增加。第一次提取導致了一個簡單的發現,即細胞內存在一種從酸性溶液中析出并溶解于堿性溶液的物質。此后,直到1953年,DNA的完整結構才被揭開。此后不久,分離核酸的標準實驗室程序開始出現,但現代用于DNA純化的方法是什么?
使用核酸分離的DNA磁珠純化是如何進行的?

核酸分離和純化包括三個基本步驟:
  • 破壞(或裂解)細胞
  • 去除蛋白質和污染物
  • 回收DNA
細胞的破壞是一個機械過程,組織通常被冷凍在液氮中,并被粉碎,以打破宏觀結構并使細胞壁破裂。然后將這種組織漿液與溶劑和鹽類混合,以洗掉不需要的蛋白質、禁用DNAses,并將DNA收集到可用的溶液中。最后,使用苯酚-氯仿有機溶劑將DNA濃縮在親水相中。然后,這種親水溶液可以被收集、離心和洗滌,直到回收純凈的DNA。
早期的方法是將DNA收集在試管底部的顆粒中,然后將其溶于水并收集。為了提高產量和簡化實驗室之間的協議,開發了固相系統。目前,使用溶劑和固相柱組合的商業試劑盒被廣泛用于分離和純化DNA和RNA [2]。

什么是柱基DNA分離?
這種方法使用專有的柱子,在隔離試劑盒中商業化銷售,這些柱子由硅石基質、玻璃顆粒、硅藻土或陰離子交換樹脂制成。DNA或RNA會與柱子相結合,而蛋白質和污染物則用離心機用乙醇洗掉。重復這一過程,最后用水收集剩余的核酸。
由于這些商業試劑盒的廣泛供應和成本低廉,DNA分離是相對容易、快速和標準化的。然而,這個過程仍然需要許多緩沖劑、溶劑、昂貴的離心機、實驗室空間和時間來完成。
所以,對提高這一過程效率的需求導致了DNA磁珠純化方法的發展。在過去20年中,納米技術的進步使磁珠DNA提取成為一種可行的、越來越有吸引力的核酸純化方法。DNA磁珠純化不需要柱子或離心機,并使該過程能夠自動化。

磁珠DNA提取是如何工作的?
磁珠是一組均勻的顆粒,直徑為500納米到500微米之間,用磁性材料制成的。這些磁性材料通常是含有磁鐵礦納米顆粒的復合材料。在有外部磁鐵的情況下,這些顆粒會被磁化,從而使它們容易被操縱。
第一個磁珠專利,「使用磁性顆粒進行DNA純化和分離」,于1998年獲得美國專利局的批準。這種早期的磁分離技術使用了由涂有硅烷的氧化鐵核心組成的顆粒。然后顆粒的表面與含有游離羧酸的分子結合,這些分子又與DNA或RNA結合。
鹽的濃度決定了官能團和核酸之間的結合強度,這使得可控的可逆結合成為可能。在正確的鹽濃度下,核酸會與磁性顆粒結合。接下來,一個磁鐵被放置在含有溶液的管子外面,以創造一個強大的外部磁場。與核酸結合的磁性顆粒被吸引到磁場中,并「粘」到管子的外邊緣。
另一種技術是在管子的底部使用一塊磁鐵來吸引顆粒向下。在這兩種情況下,在交換不需要的溶液和洗去污染的蛋白質時,磁場都被保持。洗滌步驟結束后,DNA或RNA用洗脫緩沖液從磁珠中釋放出來,留下純凈的樣品準備進行定量和分析。

功能性磁珠如何用于核苷酸提取?
近年來,對專利的DNA磁珠純化方法的修改已經被開發出來。現在的磁珠可以由嵌入氧化鐵「顏料」的合成聚合物制成,或由金屬核心的氧化鐵包覆聚合物表面以實現功能性。這些均勻的顆粒可以被涂上功能基團,也可以不被涂上。
一些功能涂層通過靜電相互作用(帶正電的胺或咪唑分子)起作用,而另一些則通過鹽或pH值介導的吸引力起作用(二氧化硅和羧基)。通過將目標寡核苷酸引入磁珠表面,可以進行更具體的DNA(或RNA)分離。這些目標寡核苷酸對于提取ssDNA或RNA的特定序列很有用。
在使用半自動或全自動系統時,DNA磁珠純化對依賴離心機的分離技術是一個明顯的改進。這些系統在需要快速純化許多樣品時使用。
在沒有DNA磁珠分離的情況下,需要將樣品移入和移出離心機的效率很低,而且會增加分析時間。相比之下,使用磁性顆粒可以使試管在整個過程中保持在一臺機器中。

有哪些磁珠分離DNA的例子?
磁珠被用來在廣泛的不同情況下純化DNA,具體包括:
質粒DNA分離:磁珠用于從粗制的提取物中分離質粒DNA。這可以通過精心優化的溶液將質粒DNA從基因組DNA和蛋白質中分離出來,然后讓質粒DNA與磁珠結合并將其引入磁場中。
基因組DNA分離:磁珠還可用于從蛋白質中分離基因組DNA,從粗提物中分離RNA。溶液中鹽分、pH值和電荷的優化意味著只有基因組DNA能與磁珠結合,然后可將其置于磁場中進行分離。
DNA片段分離:有許多類型的DNA分離試劑盒可供選擇,包括DNA片段的分離。DNA片段可能需要為下一代測序協議進行分離,在這種情況下,可以用能選擇分子大小的磁珠來分離片段。

磁珠使DNA純化變得簡單
隨著科學家們越來越深入地挖掘可觀察表型的復雜分子基礎,DNA磁珠純化技術的易用性和可擴展性將越來越有用。遺傳分析和操作是未來的方向,而使用磁鐵分離純的DNA和RNA將有助于加快發現的步伐。

上海領駿生物科技有限公司成立于2016年,位于上海市青浦區張江云立方園區。公司長期致力于生物領域內相關產品的研發、生產和銷售,產品主要包括磁性納米材料和磁珠法核酸提取純化試劑。公司一直堅持以“質量、誠信、團結、奮進”為宗旨,嚴格規范質量管理體系,持續創新、精益求精,為客戶提供優質的產品和服務,被認定為國家級高新技術企業和上海市專精特新企業。
發布者:上海領駿生物科技有限公司
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