浙江大學醫學院附屬邵逸夫醫院蔡秀軍教授在腹部外科、肝膽胰外科、微創外科、移植外科等研究方面有豐富的經驗,近期其團隊利用Arraystar circRNA芯片研究了肝細胞癌(HCC)中雄激素受體(AR)對circRNA表達的影響。研究發現AR可以結合到RNA編輯酶ADAR1的啟動子區上調ADAR1 p110的轉錄,從而抑制circRNA的表達。同時研究發現ADAR1高表達的HCC患者預后不良并且與AR表達正相關。此外,circARSP91是受AR-ADAR1調控并且下調的circRNA,可以在體外和體內抑制HCC腫瘤的生長。該研究成果2017年成功發表在國際知名學術期刊Cell Death and Disease(IF:5.965)上。(芯片實驗由康成生物提供技術服務)
研究背景
肝細胞癌(HCC)是由于復雜的遺傳和表觀遺傳改變而導致的異質性惡性腫瘤,是全球癌癥相關死亡的第二大原因。HCC的特點是具有明顯的性別差異,但其機制尚不明確。雄激素受體(AR)在HCC發生和發展過程中性別差異的作用已有文獻報道。另外,環狀RNA(circRNA)是一類新的非編碼RNA分子,通過多種機制發揮生物學功能以及影響癌癥等疾病的發生發展。作用于RNA的腺苷脫氨酶ADAR1可以通過中斷RNA編輯促進HCC的發生發展,同時有報道ADAR1是circRNA形成的關鍵調控分子。然而,由RNA編輯酶調控的circRNA在HCC中的潛在功能和分子機制至今仍然知之甚少。
本研究的目的就是通過circRNA芯片研究HCC中AR通過RNA編輯酶ADAR1抑制circRNA的表達,從而影響HCC,并通過一系列功能機制實驗研究該調控的作用機制。
研究思路
為了研究HCC中AR對circRNA表達的影響,首先作者通過qRT-PCR檢測了一些已經報道的宿主基因不受AR調控的circRNA,發現AR過表達或者敲除后circRNA表達發生下調或者上調。然后作者通過Arraystar circRNA芯片對AR高表達的HCC細胞系和AR敲除后的HCC細胞系中的circRNA表達譜進行了研究,篩選發現AR敲除后上調的有331個,遠高于下調的177個,同時上調的差異倍數也大于下調的差異倍數。這些結果表明AR可以抑制HCC中circRNA的表達。
接下來作者通過qRT-PCR以及WB實驗發現,AR可以上調RNA編輯酶ADAR1 p110 mRNA和蛋白的表達,同時ADAR1敲除后可以恢復被AR抑制的circRNA的表達。隨后通過分析TCGA數據庫中的數據以及WB和免疫組化分析發現ADAR1在HCC中表達上調并與AR正相關,另外,qRT-PCR發現HCC患者中circRNA表達下調。這些結果表明AR可以通過上調ADAR1 p110抑制HCC中circRNA的表達。同時KM曲線分析表明ADAR1高表達預示預后不良并且較易復發和進展。接下來,作者通過生信分析、ChIP及熒光素酶報告實驗證實AR能夠結合在ADAR1 p110啟動子區進而激活其轉錄。
最后作者對AR敲除后表達升高5倍以上并且來自于同一個基因PABPC1的5個circRNA進行驗證,結果發現來源于9號外顯子的circARSP91能抗RNase R消化,隨后研究發現AR通過ADAR抑制其表達。集落形成實驗、MTT及裸鼠成瘤實驗結果表明circARSP91能夠抑制腫瘤生長。
技術路線
結果展示
圖一、A:Arraystar circRNA芯片篩選的聚類圖;B:Arraystar circRNA芯片篩選的散點圖;C:qRT-PCR表明AR抑制circRNAs的表達。
圖二、A :ChIP表明AR可以結合到ADAR1啟動子區;B:熒光素酶實驗表明AR可以促進ADAR1在HCC中高表達;C:qRTPCR表明ADAR1敲除可以恢復被AR抑制的circRNA表達。
圖三、A:circARSP91來源于PABC1第9號外顯子,對RnaseR有抗性;B:qRTPCR及WB表明circARSP91可以被AR-ADAR1抑制;C:裸鼠成瘤實驗表明circARSP91可以抑制HCC腫瘤發展;D:AR通過結合到啟動子區上調ADAR1表達抑制circRNA的表達影響HCC的發生發展的模式圖。
研究意義
本研究結果表明了HCC中circRNA表達模式的一個新特征,即AR可以通過結合到ADAR1 的啟動子區上調ADAR1 p110的表達,從而抑制circRNA表達,影響HCC的發生發展。circRNA的這種表達模式有助于從新的角度解釋HCC明顯的性別差異。同時我們發現了一種新的環狀RNA circARSP91,可以在體外和體內有效抑制HCC腫瘤形成,有助于更好地了解circRNA在HCC發生和發展過程中的作用,這也為通過circRNA尋找HCC的新型治療奠定了基礎。
原文出處
Circular RNA expression is suppressed by androgen receptor (AR)-regulated adenosine deaminase that acts on RNA (ADAR1) in human hepatocellular carcinoma. Cell Death and Disease. 2017.