棉鈴蟲（Helicoverpa armigera），是夜蛾科昆蟲的一種，寄主植物有20多科200余種，其中大部分為重要栽培作物，是棉花的主要害蟲之一。棉鈴蟲單核衣殼核多角體病毒（HaSNPV）是一種桿狀病毒,能專一性地感染棉鈴蟲，作為生物殺蟲劑已得到廣泛應用。

近日澳大利亞昆士蘭大學的研究人員對棉鈴蟲免疫系統是如何應答并抵御HaSNPV侵染的機制進行研究，并將研究成果發表在Journal of Virology的10月刊上*。研究人員首先通過對感染HaSNPV的棉鈴蟲進行小RNA深度測序（LC Sciences，聯川生物美國母公司提供技術服務），發現大量small read（約20個核苷酸）可比對至HaSNPV基因組，并且這些Read比對到病毒基因組熱點區的特定開放閱讀框（ORF）上，這些ORF大部分為結構基因和輔助晚期基因。隨后，利用miRDeep在HaSNPV基因組上預測可做為pre-miRNA的潛在莖環結構。通過分析小RNA序列與潛在莖環結構的比對結果，Read count，負義鏈數量，雙鏈堿基配對數量以及其他參數，研究人員判定所有預測的莖環結構都不符合pre-miRNA的特征。在排除這些小RNA是miRNA的可能性后，這些小RNA被認定是由Dicer-2，昆蟲中參與RNAi應答的主要酶，加工產生的病毒短干擾RNA（v-siRNA）。

 

上述研究表明，昆蟲中RNAi途徑在抗RNA病毒應答過程中發揮著主要作用。應答過程為剪切雙鏈RNA基因組或復制過程中產生的中間體成為v-siRNA，然后通過降解病毒轉錄本以達到抵御病毒侵染的目的。

 

*：Jayachandran B, Hussain M, Asgari S. (2012) RNA interference as a cellular defense mechanism against the DNA virus, baculovirus. J Virol [Epub ahead of print].

 

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