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應用文章 | 使用脂質納米顆粒對人類原代 T 細胞進行基因編輯

瀏覽次數:1819 發布日期:2023-3-31  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
 

嵌合抗原受體 (CAR) 在 T 細胞上的表達將患者的細胞轉化為基于細胞的癌癥療法,并徹底改變了當今的癌癥治療格局。盡管這項技術取得了成功,并獲得了業界的積極響應,但市場對于借助 CRISPR/Cas 介導的基因編輯技術實現更復雜基因工程的需求日益高漲。復雜基因工程的應用包括:破壞腫瘤微環境所利用的抑制途徑、提高 CAR T 細胞的效率4,5和使用同種異體供體生產通用 CAR T 細胞。業界迫切希望在下一代 T 細胞療法中同時實現基因編輯和轉基因表達,這凸顯了在細胞功能、細胞產量、生產簡化和放大工藝中發揮關鍵作用的遺傳物質遞送方法的重要性

 

一種有前景的新型 T 細胞工程方法是,使用 RNA 來表達治療性蛋白質和基因編輯核酸酶。RNA 通常通過電穿孔遞送至細胞,但在多步基因工程中使用連續電脈沖時,需要在效率和細胞活力之間進行仔細權衡。脂質納米顆粒 (LNP) 則無需進行這種權衡,使其成為一種具有吸引力的 RNA 遞送替代方法。LNP 是完全合成的脂質配方,用于在將 RNA 遞送到細胞之前對其進行包封和保護。目前,LNP 的生產已經成熟,并且可放大用于大規模基因遞送和基因編輯,而這是滿足當下和未來臨床需求的關鍵。RNA-LNP 復合物在結構上與低密度脂蛋白 (LDL) 類似,并可以利用 LDL 的內源性攝取途徑,通過受體介導的內吞作用進入細胞。這種溫和的攝取機制能夠成功地進行 T 細胞基因工程,同時保持高細胞活力

在本文中,我們報告了一種使用 GenVoy-ILM T Cell Kit for mRNA 對 T 細胞進行連續基因工程的新型方法。我們利用優化的生產工作流程來遞送各種RNA(圖 1)。在本案例研究中,我們介紹了 CRISPR/Cas9 介導的 T 細胞受體 (TCRɑβ) 敲除 (KO) 技術,并探討了使用多步 LNP 工程(一種有前景的同種異體 CAR T 細胞療法)來產生 TCRɑβ KO CAR T 細胞。我們還詳細描述了 LNP 生產和細胞培養處理方案,以及 T 細胞基因編輯的優化策略,以確保使用 GenVoy-ILM T Cell Kit for mRNA 成功進行基因工程。

圖 1.使用脂質納米顆粒對人類

原代 T細胞進行基因編輯。

基因敲除是通過遞送 Cas9 mRNA 和合成向導RNA (sgRNA) 實現的。在遞送和翻譯后,Cas9 蛋白和 sgRNA 在細胞內結合,并穿梭到細胞核中進行靶基因的雙鏈斷裂。如果沒有 DNA 供體模板,絕大多數斷裂會通過易突變的非同源末端連接 (NHEJ) 進行結合,從而永久性敲除靶蛋白。

原代 T 細胞的基因編輯可以通過許多酶來實現,包括轉錄激活因子樣效應核酸酶 (TALEN)、鋅指核酸酶 (ZFN) 和成簇的規則間隔短回文重復序列 (CRISPR) Cas9。其中,CRISPR/Cas9 因易于進行靶標選擇和優化而越來越受歡迎。在 CRISPR/Cas9 介導的基因編輯中,Cas9 蛋白通過向導RNA被導向靶DNA,并誘導雙鏈斷裂,這些斷裂大多通過非同源末端連接 (NHEJ) 修復。RNA 導向的CRISPR/Cas9 系統能夠靈活地進行靶標選擇和多重基因編輯,為 CAR T 細胞治療創造了巨大的潛力

傳統上,病毒載體用于 T 細胞工程,但存在幾個限制,包括有限的包載量、不良免疫反應和高生產成本。為了避免病毒載體的這些缺點,電穿孔的使用日益普及;然而,如上所述,同時實現基因編輯和蛋白質表達所需的連續電脈沖可能對細胞有害。這會降低細胞活力和產量,造成基因失調,并增加細胞衰竭標記基因的表達。

盡管 LNP 相關研究的數量有限,但 Billingsley 等人的兩項近期研究表明,與電穿孔和/或慢病毒轉染相比,原代 T 細胞中 LNP 介導的 CD19 CAR mRNA 表達具有同等的腫瘤殺傷效力。

GenVoy-ILM™ T Cell Kit for mRNA 提供了一種臨床相關、可放大的 LNP 基因編輯方法,以推進細胞治療領域的發展,其利用的LNP技術也是變革新冠肺炎mRNA疫苗開發工作的強大技術。這項工作旨在展示 LNP 在治療性蛋白表達和先進 T 細胞工程中的強大作用。我們對用于包封商用 Cas9 mRNA 和向導 RNA (sgRNA) 的 LNP 的封裝、包載比率和多導向組合進行了優化。此外,我們展示了 LNP 可以無縫整合到標準原代 T 細胞培養工作流程中,以及多次 LNP 添加如何產生基因編輯的 CAR T 細胞。借助 NanoAssmblr® Spark 微流控平臺,這些研發規模的 RNA-LNP 在不到 5 分鐘的時間內產生,并直接添加到細胞中。

這項工作表明,使用 GenVoy-ILM T Cell Kit for mRNA 生產的 LNP 能夠高效地進行靶標敲除(兩個 sgRNA 為 80 ± 8%)和 CAR 蛋白表達 (91 ± 5%),同時保持高細胞活力 (> 90%)。所得的基因編輯 CAR T 細胞與白血病細胞共培養,并顯示出效的靶標特異性殺傷作用,而基因編輯本身對治療潛力沒有負面影響。

圖 2.原代 T 細胞基因編輯和多步工程工作流程。


第 1 天 - 解凍并活化凍存的人類原代 Pan T 細胞。第 1-4 天 – 生產 LNP,評估 RNA 包封效率以確定劑量。第 4 天 - 活化的 T 細胞與基因編輯 RNA-LNP 一起孵育。第 4-11 天 - 細胞擴增以增加細胞數量用于隨后的實驗。第 13 天 - 用 CAR mRNA-LNP 處理基因編輯細胞,表達治療性抗 CD19 CAR 蛋白。第 14 天 – CAR 處理后約 24 小時,進行針對腫瘤靶標的細胞毒性試驗。
 

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發布者:Precision NanoSystems
聯系電話:400-810-9118
E-mail:xiaoqun.zhou@cytiva.com

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