總體上說，電噴霧質(zhì)譜對鹽的耐受能力較低。
 
鹽類包括：小分子鹽（有機(jī)鹽、無機(jī)鹽）、大分子鹽（低聚合物）等。一般小分子鹽的摩爾濃度比較高，在電噴霧系統(tǒng)中有強(qiáng)烈的競爭性離子化作用，導(dǎo)致較強(qiáng)的離子抑制效應(yīng)，使得待測物的靈敏度明顯降低。其次，鹽類的存在將產(chǎn)生一系列的離子加合峰，使得譜圖的解析變復(fù)雜。此外，太多的鹽類會腐蝕和污染質(zhì)譜系統(tǒng)硬件，嚴(yán)重時導(dǎo)致硬件損壞，需要及時清洗。
 
對于液質(zhì)聯(lián)用來說，反相體系有較高的鹽耐受力。需要根據(jù)柱子系統(tǒng)有目標(biāo)的控制鹽濃度。一般，鹽濃度太高時，可稀釋到2M以下再進(jìn)樣。
 
需要注意的是，一些不揮發(fā)鹽，如磷酸鹽、氯化鈉等，盡量少用。
 
在某些場合，需要加特定的微量鹽類以增加被測物的離子化，如糖類，核苷酸類等。
 
簡單地說，高濃度的鹽對電噴霧有明顯負(fù)作用。微量鹽可能有助于某些物質(zhì)的靈敏度提高。
 
在進(jìn)樣前，一般要進(jìn)行脫鹽處理。最簡單的方法是稀釋（如果待測樣本的濃度較高），然后是脫鹽柱（分子篩、反相等）、超濾、沉淀或萃取、離子交換等方法。

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