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基因組生物信息學分析

基因組生物信息學分析


基因組生物信息學分析
通過生物信息學的方法解讀微生物的基因組信息,使人們迅速得獲得一個微生物的大部分基因功能信息;利用獲取的信息與已知的近緣微生物基因組進行比較分析,進一步挖掘序列背后的生物學意義,為生物學家提供指導。
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最后更新:2009-9-15半年訪問:17
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基因組生物信息學分析

    通過生物信息學的方法解讀微生物的基因組信息,使人們迅速得獲得一個微生物的大部分基因功能信息;利用獲取的信息與已知的近緣微生物基因組進行比較分析,進一步挖掘序列背后的生物學意義,為生物學家提供指導。

    功能基因組注釋
    基因預測 
    基因功能注釋 
    蛋白質功能分類
    蛋白質亞細胞定位
    rDNA和tRNA基因預測
    IS element和Prophage預測

    功能基因組分析
    Paralog和Ortholog計算
    代謝通路的構建
    基因島和水平轉移基因的發現
    基因組多態性的分析
    基于同源基因的DN/DS計算的進化分析

    cDNA文庫分析 
    原始序列前期處理 (去除載體,低質量序列,污染等)
    文庫隨機性檢測
    文庫基因飽和度預測
    序列聚類拼接
    基因注釋 (功能注釋,結構域預測等)
    功能分類(GO,MIPS等)
    基因表達量分析
    文庫基因總體分析(KEGG代謝途徑)
    基因可變剪接分析
    文庫之間相互比較
    自動化分析平臺構建

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