該芯片可一次雜交12個樣本,以提供高通量的,價格低廉的,以及不需要特殊設備的樣本檢測。該芯片旨在使檢測更加靈活以適用不同實驗的要求。
※小鼠MouseWG-6 v2.0全基因組表達譜微珠芯片
每張芯片可同時檢測6個樣本,每樣本分析超過45200個轉(zhuǎn)錄本,基因信息來自于NCBI RefSeq database (Build 36, Release 22)、RIKEN FANTOM2 database、RefSeq Release 5(Build 33.1)以及MEEBO(Mouse Exonic Evidence Based Oligonucleotide)
※小鼠MouseRef-8 v2.0全基因組表達譜微珠芯片
每張芯片可同時檢測8個樣本,每樣本分析超過25600個轉(zhuǎn)錄本,基因信息來自于NCBI RefSeq database(Build 36, Release 22)
※大鼠RatRef-12全基因組表達譜微珠芯片
每張芯片可同時檢測12個樣本,每樣本分析超過22000個轉(zhuǎn)錄本,基因信息來自于NCBI RefSeq database(Release 16)
※Illumina定制芯片
根據(jù)用戶要研究的基因列表,進行生物信息學分析及實驗驗證挑選動力學反應最好的探針,用BeadArrayTM技術制成可同時檢測16個樣本的Sentrix Bead Chip芯片或同時檢測96個樣本的Sentrix Array Matrix芯片,每樣本可分析1400個人、小鼠、大鼠基因或700個其他物種基因
為了提供更多有生物學意義的結果,該芯片按照最新的數(shù)據(jù)庫設計了覆蓋全基因組范圍的檢測探針,主要包括已知基因,候選基因和不同的剪切體。
每張芯片上包含了31000多個來自最新的NCBI數(shù)據(jù)庫(NCBI) RefSeq Release 38 (November 7, 2009)的基因信息并為這些基因設計了超過47000個探針。
——一次檢測12樣本使得大規(guī)模的表達譜可以以更快的速度和更低廉的價格進行
——在芯片采用直接雜交法進行檢測,并用iScan, BeadArray Reader或HiScanSQ進行掃描
——樣品標記最少只需50ng總RNA即可完成
探針信息:
HumanHT-12 v4
RefSeq content (Release 38)
NM(成熟的mRNA) 28688
XM(轉(zhuǎn)錄序列) 11121
NR(不編碼的RNA,假基因或其他) 1752
XR(不編碼的轉(zhuǎn)錄序列) 2029
其他來源
Unigene數(shù)據(jù)庫 3461
總計 47231