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與翔科飛提供專業(yè)的生物信息學(xué)服務(wù),包括生物信息學(xué)軟件定制、設(shè)計及算法整合、具體疑難生物學(xué)數(shù)據(jù)分析、高通量生物學(xué)數(shù)據(jù)分析,以及基于生物信息學(xué)分析探路的實驗路線設(shè)計等。
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讀取測序峰圖(Base calling) 通過分析測序峰圖文件,讀取DNA堿基序列信息以及各個堿基的測序質(zhì)量得分。
EST序列質(zhì)控(Quality control) 屏蔽簡單重復(fù)序列,載體序列,引物序列,低質(zhì)量測序部分序列等。
文庫基因注釋(Gene annotation)將EST文庫序列通過合適的blast方法比對到各個標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫,從而獲取EST到已知基因的對應(yīng)關(guān)系。
基 因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 富集分析是基于統(tǒng)計學(xué)檢驗的case/control高通量分析方法,可用于揭示生物學(xué)樣本(case相對于control)中被顯著激活或顯著抑制的功 能。與翔自主開發(fā)研制了不同的功能分析數(shù)據(jù)庫,可以提供對GO、KEGG、BioCarta、疾病相關(guān)基因、腫瘤相關(guān)基因、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點等功能的富集 分析。
基因功能注釋(Gene function annotation),通過KOG/COG數(shù)據(jù)庫完成EST序列的功能注釋