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類器官串聯(lián)芯片培養(yǎng)微生理系統(tǒng)等“新方法學(xué)"(NAMs)的介紹及應(yīng)用

瀏覽次數(shù):301 發(fā)布日期:2025-4-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

1. 背景研究:傳統(tǒng)毒理學(xué)的局限性與動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的挑戰(zhàn)
1.1 動(dòng)物模型的科學(xué)局限性  
傳統(tǒng)毒理學(xué)依賴動(dòng)物實(shí)驗(yàn)(如嚙齒類和非人靈長(zhǎng)類)評(píng)估化學(xué)物質(zhì)的安全性,但其科學(xué)有效性面臨多重質(zhì)疑。種間差異是核心問題:例如,小鼠肝臟代謝通路與人類存在顯著差異,導(dǎo)致約60%的肝毒性藥物在動(dòng)物試驗(yàn)中未能預(yù)測(cè)人體反應(yīng)(如曲格列酮事件)。此外,動(dòng)物模型難以模擬復(fù)雜的人類疾病表型(如神經(jīng)退行性疾病或免疫介導(dǎo)的毒性),且短期暴露實(shí)驗(yàn)無法捕捉慢性毒性效應(yīng)。  

1.2 倫理爭(zhēng)議與社會(huì)壓力  
“3R原則"(替代、減少、優(yōu)化)自1959年提出后,逐漸成為全球共識(shí)。歐盟《化妝品指令》(2013)全面禁止動(dòng)物實(shí)驗(yàn),美國(guó)EPA曾提出了預(yù)計(jì)2035年前淘汰哺乳動(dòng)物測(cè)試。公眾對(duì)動(dòng)物福利的關(guān)注與立法壓力迫使行業(yè)加速尋找替代方案。  

1.3 成本與效率瓶頸  
一項(xiàng)新藥的臨床前毒性測(cè)試需耗費(fèi)約1.5億美元和6年時(shí)間,而90%的候選藥物因毒性問題在臨床試驗(yàn)中失敗。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的低通量和高成本已成為創(chuàng)新藥開發(fā)的重大障礙。

2. 行業(yè)發(fā)展:類器官與器官芯片的技術(shù)演進(jìn)與監(jiān)管推動(dòng)
2.1 類器官技術(shù)的崛起:從二維到三維  
類器官(Organoids)通過干細(xì)胞自組織形成微型器官結(jié)構(gòu),保留原組織的細(xì)胞異質(zhì)性與功能。例如,肝臟類器官可模擬藥物代謝酶活性,腸類器官能重現(xiàn)腸屏障與免疫反應(yīng)。2013年,Hans Clevers團(tuán)隊(duì)shou ci實(shí)現(xiàn)人腸道類器官培養(yǎng),標(biāo)志著技術(shù)進(jìn)入實(shí)用化階段。  

2.2 Kikstall串聯(lián)式器官芯片的多元化應(yīng)用場(chǎng)景  
器官芯片(Organs-on-Chips)通過微流控技術(shù)模擬器官微環(huán)境,如Kirkstall Quasi Vivo 北京基爾比生物公司的“肺芯片" 其核心優(yōu)勢(shì)在于:  

- 動(dòng)態(tài)灌注系統(tǒng):模擬血液流動(dòng)與營(yíng)養(yǎng)供給;  

- 多器官串聯(lián):評(píng)估全身性毒性(如肝-肺軸相互作用);  

- 實(shí)時(shí)暴露與監(jiān)測(cè):整合煙霧吸入發(fā)生,PM2.5氣溶膠霧化發(fā)生,臭氧/微塑料等新污染物發(fā)生器,兼容便于檢測(cè)代謝物或細(xì)胞應(yīng)激標(biāo)志物。  

2.3 全球監(jiān)管框架的轉(zhuǎn)型  
美國(guó)EPA通過“新方法學(xué)"(NAMs)戰(zhàn)略,將類器官數(shù)據(jù)納入化學(xué)品風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。OECD發(fā)布《體外皮膚致敏測(cè)試指南》(TG 442E),認(rèn)可GARDskin等轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物標(biāo)志物。2022年,F(xiàn)DA啟動(dòng)“動(dòng)物實(shí)驗(yàn)替代計(jì)劃",優(yōu)先審查基于器官芯片的IND申請(qǐng)。 2025年4月10日,F(xiàn)DA發(fā)布的《減少臨床前安全研究中動(dòng)物測(cè)試路線圖》系統(tǒng)性地提出了通過“新方法學(xué)"(NAMs)替代傳統(tǒng)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的戰(zhàn)略框架。NAMs涵蓋器官芯片、計(jì)算機(jī)建模(如AI預(yù)測(cè)、PBPK模型)、體外人類細(xì)胞系統(tǒng)等。

3. dian fu創(chuàng)新:類器官&Kirkstall器官串聯(lián)芯片的技術(shù)突破與毒理學(xué)范式轉(zhuǎn)移
3.1 多器官串聯(lián)與系統(tǒng)性毒性評(píng)估  
單一器官模型無法捕捉代謝產(chǎn)物的遠(yuǎn)端效應(yīng)。Kirkstall Quasi Vivo類器官3D動(dòng)態(tài)構(gòu)建系統(tǒng) 通過模塊化設(shè)計(jì)連接肺、肝、心、腎等芯片,模擬藥物ADME(吸收、分布、代謝、排泄)過程。例如,某抗癌藥在肝臟代謝后生成的活性代謝物可能對(duì)心臟產(chǎn)生毒性,此類系統(tǒng)性效應(yīng)僅能通過多器官串聯(lián)模型檢測(cè)。  

3.2 高通量篩選與人工智能驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)分析  
結(jié)合機(jī)器人自動(dòng)化與AI算法,類器官芯片可實(shí)現(xiàn)千級(jí)化合物/周的測(cè)試通量。如DeepMind開發(fā)的毒性預(yù)測(cè)模型,通過分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(如TG-GATEs數(shù)據(jù)庫)與器官芯片表型數(shù)據(jù),準(zhǔn)確率比傳統(tǒng)方法提升40%。  

3.3 毒理基因組學(xué)的深度整合  
《Progress in toxicogenomics to protect human health》發(fā)表于《Nature Reviews Genetics》,由Matthew J. Meier等人撰寫,系統(tǒng)回顧了毒理基因組學(xué)(toxicogenomics)在保護(hù)人類健康方面的進(jìn)展。Kirkstall串聯(lián)器官芯片如何<a class=

3.3.1. 毒理基因組學(xué)的定義與目標(biāo)
毒理基因組學(xué)通過測(cè)量分子特征(如轉(zhuǎn)錄本、蛋白質(zhì)、代謝物和表觀基因組修飾)來理解和預(yù)測(cè)環(huán)境和藥物暴露的毒性效應(yīng)。其目標(biāo)是通過早期、更準(zhǔn)確的毒性預(yù)測(cè),減少對(duì)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的依賴,并提高毒理學(xué)研究的效率和精準(zhǔn)性。

3.3.2. 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在毒理學(xué)中的應(yīng)用
轉(zhuǎn)錄組學(xué)已成為毒理基因組學(xué)的核心工具,通過高通量基因表達(dá)分析提供機(jī)制和定量信息。轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)可用于預(yù)測(cè)毒性風(fēng)險(xiǎn),通過轉(zhuǎn)錄組生物標(biāo)志物、網(wǎng)絡(luò)推斷分析、模式匹配方法和人工智能技術(shù)實(shí)現(xiàn)。

3.3.3. 實(shí)驗(yàn)方法
毒理基因組學(xué)研究通常涉及在體外或體內(nèi)暴露于不同劑量、暴露時(shí)間和組織類型下的轉(zhuǎn)錄組變化。研究設(shè)計(jì)基于具體問題,可能需要大樣本量進(jìn)行成對(duì)比較,或在多個(gè)處理組中模擬數(shù)據(jù)趨勢(shì)(如劑量-反應(yīng))。

3.3.4. 數(shù)據(jù)收集與分析
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)收集從表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)發(fā)展到基于雜交的微陣列技術(shù),再到目前廣泛使用的RNA測(cè)序(RNA-seq)。數(shù)據(jù)分析從識(shí)別差異表達(dá)基因(DEGs)開始,常用軟件包括DESeq2、edgeR和limma。此外,還通過基因集富集分析(GSEA)等方法整合DEGs與生物通路,以揭示毒性機(jī)制。

3.3.5. 發(fā)現(xiàn)機(jī)制與預(yù)測(cè)風(fēng)險(xiǎn)
路徑和網(wǎng)絡(luò)分析是篩選大型轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集、識(shí)別毒理學(xué)機(jī)制和潛在健康影響的強(qiáng)大工具。然而,轉(zhuǎn)錄組變化與毒性結(jié)果之間的復(fù)雜關(guān)系給解釋帶來了挑戰(zhàn)。為此,預(yù)測(cè)毒理學(xué)應(yīng)運(yùn)而生,通過模式匹配方法(如聚類分析和連通性映射)開發(fā)轉(zhuǎn)錄組生物標(biāo)志物,以客觀、高效和可重復(fù)地將分子變化與毒性機(jī)制和風(fēng)險(xiǎn)聯(lián)系起來。

3.3.6. 轉(zhuǎn)錄組劑量-反應(yīng)建模
傳統(tǒng)的毒理學(xué)通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中的臨床和病理終點(diǎn)確定可接受暴露水平(即無不良效應(yīng)的最高劑量,POD)。毒理基因組學(xué)引入了轉(zhuǎn)錄組POD(tPOD),通過短期動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中的轉(zhuǎn)錄組變化來確定POD。研究表明,tPOD與傳統(tǒng)POD之間高度一致,表明轉(zhuǎn)錄組變化可以作為健康保護(hù)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的有效工具。

3.3.7. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)
單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)能夠測(cè)量單個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá),揭示細(xì)胞類型特異性的轉(zhuǎn)錄組變化。這些技術(shù)在毒理學(xué)中的應(yīng)用尚處于起步階段,但已顯示出在理解細(xì)胞類型特異性毒性機(jī)制方面的巨大潛力。

3.3.8. 系統(tǒng)毒理學(xué)與多組學(xué)
系統(tǒng)毒理學(xué)通過整合多組學(xué)數(shù)據(jù)(如轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等)來全面表征化學(xué)物質(zhì)引起的分子終點(diǎn)。多組學(xué)方法已在臨床毒理學(xué)和環(huán)境暴露研究中得到應(yīng)用,未來需要解決數(shù)據(jù)整合和解釋的挑戰(zhàn)。

3.3.9. Kikstall Quasi Vivo 串聯(lián)式器官芯片在毒理基因組學(xué)中的應(yīng)用
毒理基因組學(xué)已成為毒理學(xué)研究的核心組成部分,并有望成為現(xiàn)代風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的基石。盡管轉(zhuǎn)錄組學(xué)尚未wan quan實(shí)現(xiàn)其在監(jiān)管測(cè)試中的潛力,但其在毒性測(cè)試中的應(yīng)用正在向定量劑量-反應(yīng)建模轉(zhuǎn)變,以確定保護(hù)健康的暴露限值。

未來,毒理基因組學(xué)有望通過類器官與串聯(lián)式器官芯片,例如Kirkstall Quasi Vivo多器官串聯(lián)培養(yǎng)技術(shù),結(jié)合AI人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)在毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析中發(fā)揮重要作用提供更深入的毒性效應(yīng)見解,減少毒性測(cè)試中所需的動(dòng)物數(shù)量,并加速對(duì)人群健康影響的評(píng)估。

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4. 展望未來:Kirkstall Quasi Vivo類器官動(dòng)態(tài)構(gòu)建系統(tǒng)的創(chuàng)新與應(yīng)用潛力
4.1 Kirkstall Quasi Vivo的技術(shù)優(yōu)勢(shì)與設(shè)計(jì)哲學(xué): 其設(shè)計(jì)哲學(xué)強(qiáng)調(diào)“簡(jiǎn)化復(fù)雜性",通過標(biāo)準(zhǔn)化接口降低用戶操作門檻。  

- 模塊化流體網(wǎng)絡(luò):獨(dú)立腔室通過生物相容性管道連接,支持定制化器官組合;  

- 生理剪切應(yīng)力:模擬真實(shí)血流動(dòng)力學(xué),維持細(xì)胞功能;  

- 長(zhǎng)期培養(yǎng)穩(wěn)定性:適合慢性毒性研究。  

4.2 應(yīng)用案例:從藥物開發(fā)到環(huán)境毒理  
- 藥物肝毒性評(píng)估:某制藥公司使用肝-心臟串聯(lián)芯片,發(fā)現(xiàn)候選藥物代謝產(chǎn)物引發(fā)QT間期延長(zhǎng),提前終止開發(fā),節(jié)約成本2億美元;  

- 納米材料安全性測(cè)試:Quasi Vivo模擬肺泡-肝軸,揭示碳納米管通過氧化應(yīng)激誘發(fā)肝纖維化,補(bǔ)充傳統(tǒng)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的盲點(diǎn);  

- 個(gè)性化醫(yī)療:結(jié)合患者來源類器官,預(yù)測(cè)個(gè)體化化療方案的骨髓抑制風(fēng)險(xiǎn)。  

5. 結(jié)論:從補(bǔ)充—替代到超越——毒理學(xué)的未來圖景

Kirkstall Quasi Vivo類器官串聯(lián)芯片培養(yǎng)微生理系統(tǒng)等“新方法學(xué)"(NAMs)不僅是動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的補(bǔ)充或替代方案,更是毒理學(xué)范式的革命。通過整合多組學(xué)、微生理系統(tǒng)與AI,未來毒理學(xué)將實(shí)現(xiàn):  

- 精準(zhǔn)預(yù)測(cè):基于機(jī)制的多層次毒性評(píng)估;  

- 動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè):實(shí)時(shí)追蹤毒性演化的時(shí)空軌跡;  

- 全局優(yōu)化:從分子到生態(tài)系統(tǒng)的全鏈條安全設(shè)計(jì)。  

隨著監(jiān)管壁壘的突破與技術(shù)成本的下降,類器官技術(shù)的更加完善,一個(gè)“人體體外重建"的新時(shí)代即將來臨,不久的將來,Kirkstall Quasi Vivo類器官串聯(lián)芯片系統(tǒng)等“新方法學(xué)"(NAMs)有望成為毒理測(cè)試的黃金標(biāo)準(zhǔn),最終實(shí)現(xiàn)“零動(dòng)物實(shí)驗(yàn)"的愿景。

發(fā)布者:北京基爾比生物科技有限公司
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