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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+16S揭示腸道微生物或能為機(jī)體免疫系統(tǒng)“充電”

瀏覽次數(shù):1106 發(fā)布日期:2022-4-22  來源:中科新生命
腸道微生物群的組成與腫瘤的發(fā)展和抗腫瘤免疫的功效有關(guān)。匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院Timothy Hand教授研究團(tuán)隊(duì)在Immunity (31.428)雜志上發(fā)表了一篇研究論文,名為“Microbiota-specific T follicular helper cells drive tertiary lymphoid structures and anti-tumor immunity against colorectal cancer”,揭示了帶有免疫原性腸道細(xì)菌肝螺桿菌(Hhep)定殖結(jié)腸腫瘤小鼠,誘導(dǎo)Hhep特異性T濾泡輔助細(xì)胞和腫瘤鄰近的三級淋巴結(jié)構(gòu)(TLSs)擴(kuò)張,從而促進(jìn)抗腫瘤免疫。


研究材料
AOM-DSS模型鼠、AOM-DSS+Hhep小鼠

技術(shù)路線
· 步驟1:表型數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)Hhep定殖介導(dǎo)了結(jié)腸癌中強(qiáng)大的抗腫瘤作用;
· 步驟2:單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示Hhep定殖增加細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞的腫瘤浸潤并促使TLSs的擴(kuò)張;
· 步驟3:Tfh 細(xì)胞是 Hhep 介導(dǎo)的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的。

研究結(jié)果
1. Hhep定殖重塑結(jié)直腸癌腫瘤微環(huán)境
前人的研究表明,Hhep菌(一種具有內(nèi)在免疫原性的腸道細(xì)菌)定殖荷瘤小鼠引發(fā)的特異性免疫反應(yīng)可修飾結(jié)腸癌微生物群結(jié)構(gòu),導(dǎo)致抗腫瘤免疫增強(qiáng)。本研究,作者將Hhep菌定殖于生長7周的結(jié)直腸癌(CRC)小鼠模型中,相對于對照組(荷瘤小鼠無Hhep菌定殖),Hhep定殖顯著減少了腫瘤的數(shù)量和大小,延長了小鼠的生存周期。同時(shí),Hhep定殖對腫瘤小鼠的腸道微生物群產(chǎn)生影響,以及腫瘤的免疫細(xì)胞浸潤增加。以上結(jié)果表明,Hhep定殖介導(dǎo)了結(jié)腸癌中強(qiáng)大的抗腫瘤作用


圖1 Hhep可降低腫瘤負(fù)荷并增加CRC的生存周期

2. Hhep驅(qū)動的抗腫瘤免疫
為了更全面的了解Hhep定殖對CRC TME的影響,作者對腫瘤上皮層細(xì)胞(epithelial layer,EL)進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,共鑒定出12個(gè)細(xì)胞簇,Hhep定殖誘導(dǎo)了細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞(簇1)和效應(yīng)T細(xì)胞(簇5)的增加。其中細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞包含多種不同的NK細(xì)胞和T細(xì)胞(CD8+、CD4+),表達(dá)與細(xì)胞毒性功能相關(guān)的基因(Gzma)。以上數(shù)據(jù)表明,Hhep定殖增加細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞的腫瘤浸潤


圖2  Hhep定殖導(dǎo)致腫瘤TME的細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞的增加

3. Hhep定殖促使TLSs擴(kuò)張
前人的研究表明,Hhep特異性CD4+T細(xì)胞主要在結(jié)腸固有層( lamina propria,LP)中積累(Chai et al., 2017; Xu et al., 2018),因此作者利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序分析了Hhep定殖對LP的影響。聚類分析揭示了表達(dá)與基質(zhì)和內(nèi)皮細(xì)胞相關(guān)基因的細(xì)胞(簇 1、5、9 和 13)的富集,特別是 Hhep 定殖小鼠中 Ccl21a+Lyve1+ 淋巴管簇(簇 9、子簇 2)的增加。同時(shí),作者觀察到 LP 中淋巴管生成所需基因(Pdpn,Vegfc)的頻率增加,熒光顯微鏡顯示 Lyve-1 染色增加。Hhep定殖的小鼠顯示腫瘤周圍和腫瘤內(nèi)部的TLSs數(shù)量增加,與TLS形成相關(guān)的基因表達(dá)增加,以上數(shù)據(jù)表明,Hhep 定殖促使小鼠結(jié)腸淋巴網(wǎng)絡(luò)的擴(kuò)張


圖3 Hhep定殖擴(kuò)大了結(jié)腸淋巴網(wǎng)絡(luò)

4. Hhep定殖驅(qū)動Hhep特異性CD4+Tfh細(xì)胞擴(kuò)增
抗體介導(dǎo)的耗竭實(shí)驗(yàn)顯示,抗腫瘤免疫不依賴于CD8+T細(xì)胞,但依賴于CD4+T細(xì)胞。因此,作者分析了結(jié)腸中CD4+T細(xì)胞對Hhep定殖的反應(yīng),流式結(jié)果顯示,在Hhep定殖后,CD4+ T細(xì)胞中Tfh細(xì)胞(CXCR5+PD1+CD4+ T cells)的百分比持續(xù)增加,即在結(jié)直腸腫瘤的背景下,Hhep定殖驅(qū)動Hhep特異性Tfh細(xì)胞擴(kuò)增


圖4  Hhep定殖驅(qū)動Hhep特異性Tfh細(xì)胞擴(kuò)增

5. Tfh細(xì)胞是Hhep菌介導(dǎo)的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的
對TLSs進(jìn)行FISH染色發(fā)現(xiàn)TLSs中含有Hhep菌和Hhep特異性T細(xì)胞。為了測試Hhep特異性Tfh細(xì)胞在TLS誘導(dǎo)和直接控制CRC中的重要性,作者利用AOM-DSS+Hhep處理Bcl6fl/flCd4Cre小鼠(Tfh 細(xì)胞缺陷型)誘導(dǎo)CRC證實(shí)了Tfh細(xì)胞是Hhep驅(qū)動的結(jié)腸TLS形成、腫瘤的免疫浸潤和控制腫瘤生長所必需的。所有數(shù)據(jù)表明,在CRC動物模型中,Hhep特異性Tfh細(xì)胞足以驅(qū)動TLS形成、增加免疫浸潤并導(dǎo)致腫瘤減少或清除。癌癥基因組圖譜 (TCGA) 數(shù)據(jù)庫中對CRC患者的分析表明,豐富的Tfh細(xì)胞特征通常存在于處于較低腫瘤階段的患者體內(nèi),并且還與更長的無進(jìn)展生存期相關(guān),因此,在小鼠和人類患者中,Tfh細(xì)胞和TLS的存在與更好地控制CRC相關(guān)。


圖5 Tfh細(xì)胞是Hhep菌介導(dǎo)的腫瘤控制和免疫浸潤所必需的

小編小結(jié)
綜上,本文利用最新的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)聯(lián)合腸道微生物測序技術(shù),揭示了肝螺桿菌增強(qiáng)了適應(yīng)性免疫反應(yīng),并促使輔助T細(xì)胞和產(chǎn)生抗體的B細(xì)胞的選擇性激活,小鼠結(jié)腸腫瘤縮小,延長了小鼠的生存周期。這項(xiàng)開創(chuàng)性研究為利用腸道微生物群治療(對常規(guī)藥物和免疫療法耐藥的)結(jié)直腸癌腫瘤提供了強(qiáng)有力的證據(jù)。

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發(fā)布者:上海中科新生命生物科技有限公司
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