配合力試驗(yàn)設(shè)計(jì)，常用到的是1948年由Comstock 和Robinson提出的NCⅡ設(shè)計(jì)（North Carolinadesign Ⅱ）。配合力試驗(yàn)，即便設(shè)計(jì)參數(shù)不同，也大致都是一組母本和另一組父本雜交，有的試驗(yàn)設(shè)計(jì)含有正反交，測(cè)量后代F1的產(chǎn)量（或其他性狀），用后代表現(xiàn)來(lái)評(píng)價(jià)親本育種價(jià)值，選擇親本。

在一般配合力Σ效應(yīng)=0的條件約束下，一個(gè)配合力試驗(yàn)中獲得的效應(yīng)值，只相對(duì)于該配合力試驗(yàn)群體才有意義。

從另一角度來(lái)說(shuō)，假設(shè)有兩個(gè)獨(dú)立的配合力試驗(yàn)，母本都采用相同的一組材料（M群體），采用不同的兩組材料做父本（A群體、B群體），分別進(jìn)行配合力試驗(yàn)，兩組試驗(yàn)都對(duì)母本材料進(jìn)行一般配合力效應(yīng)分析，結(jié)果一定不同，甚至兩個(gè)試驗(yàn)分別得到的母本（M群體）一般配合力效應(yīng)大小排序都不同。

如果A群體、B群體是測(cè)驗(yàn)種，或是骨干親本自交系，就意味著育種者在設(shè)計(jì)配合力試驗(yàn)之前，已經(jīng)進(jìn)行了育種選擇，是測(cè)驗(yàn)種決定了選擇結(jié)果，接下來(lái)的選擇工作更多的是沿著測(cè)驗(yàn)種決定的選擇方向，進(jìn)行積累和提高，進(jìn)行差值選擇育種。

有的育種者會(huì)將上面試驗(yàn)中的父本（A群體、B群體）干脆合為一個(gè)父本群體，只設(shè)計(jì)一個(gè)配合力試驗(yàn)，豈不更好，這樣對(duì)母本（M群體）的評(píng)價(jià)一定會(huì)更可靠更全面。但受實(shí)際工作量，經(jīng)營(yíng)成本制約，父本群體一定是有限的。

配合力方法的效應(yīng)（離差）決定了每一步的選擇方向，而配合力試驗(yàn)的效應(yīng)直接受試驗(yàn)群體父母本影響和左右，進(jìn)一步說(shuō)，這其中常用作父本的測(cè)驗(yàn)種，可以說(shuō)更多決定了一家育種單位育種工作的未來(lái)。如果兩家育種單位都使用同一材料做為測(cè)驗(yàn)種，而且都依據(jù)配合力方法進(jìn)行育種，在技術(shù)路線一直保持不變的情況下，理論上，若干年后，這兩家育種單位的品種會(huì)趨于同質(zhì)化。這里的同質(zhì)化跟套牌導(dǎo)致的同質(zhì)化可不一樣。如果這樣的選擇積累確實(shí)體現(xiàn)了當(dāng)下育種的最佳基因組合，那就在階段性平臺(tái)上徘徊，期待上新的臺(tái)階，如果不是這樣，那育種者最好為避免這樣的情況出現(xiàn)做好方法和技術(shù)準(zhǔn)備，采用比一般配合力更有效的選擇策略------育種值或者考慮采用符合雜優(yōu)種質(zhì)要求的差異化的測(cè)驗(yàn)種。

配合力方法之對(duì)育種的作用，體現(xiàn)在用一般配合力選擇母本，持續(xù)提升母本的育種價(jià)值，用特殊配合力找尋父本，于是自然就演變出了SS-NSS的兩群雜優(yōu)育種模式。