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客戶文獻(xiàn) | 首篇梅毒患者血清的非靶代謝組學(xué)研究發(fā)表!

瀏覽次數(shù):4005 發(fā)布日期:2019-4-29 
 關(guān)鍵詞:非靶代謝,診斷標(biāo)志物,梅毒血清,中科新生命

梅毒是世界范圍內(nèi)一種常見的性傳播疾病,致病病原體是梅毒螺旋體,2017年,中國疾控中心報告梅毒新發(fā)病例47.5860萬例,死亡45人,在所有乙類傳染病中排名第三位。

今天小編要為各位老師解讀一篇APT客戶廈門大學(xué)附屬中山醫(yī)院楊天賜課題組最近發(fā)表的文獻(xiàn),是首篇對梅毒患者進(jìn)行代謝組學(xué)研究的文章,并篩選到了可以用于梅毒診斷的標(biāo)志物,其中中科新生命提供非靶向代謝組學(xué)檢測。

梅毒的診斷和發(fā)病機(jī)制仍是臨床研究的難點(diǎn)。目前梅毒的診斷主要依賴血清學(xué)檢測(包括非密螺旋體和密螺旋體抗體檢測),血清學(xué)檢查的假陰性結(jié)果以及該方法的局限性可能阻礙梅毒的及時診斷和治療,科學(xué)家們?nèi)栽趯ふ腋舾小⒏禺惖拿范驹\斷標(biāo)志物。

在本研究首次利用非靶代謝組學(xué)方法尋找梅毒患者血清中代謝診斷標(biāo)志物。

JEADV

Analysis of Serum Metabolite Profiles in Syphilis Patients by Untargeted Metabolomics

2019  IF=4.287

原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jdv.15530

研究材料:血清樣本,20例梅毒患者,20例健康人

研究結(jié)果:

01、質(zhì)控評價

代謝的個體化差異大,生物學(xué)重復(fù)數(shù)多,且不做混樣,因此對儀器穩(wěn)定性的要求高。通過QC樣本的質(zhì)控評價可以對儀器的穩(wěn)定性進(jìn)行評價,從而判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量的好壞。

通過PCA分析,可以看到圖中所有的QC樣本(藍(lán)色的點(diǎn))都緊密地聚集在一起,表明實(shí)驗過程中儀器穩(wěn)定性良好,數(shù)據(jù)可靠。 

 

圖1

02、血清代謝組學(xué)結(jié)果

基于UPLC-Q-TOF/MS技術(shù),總鑒定到2890個特征峰,通過PLS-DA、層次聚類熱圖分析表明,梅毒患者和健康組在代謝水平上有著明顯得分離趨勢。

圖2

圖3

03、篩選潛在生物標(biāo)志物

滿足VIP>1,P<0.05差異篩選標(biāo)準(zhǔn)的顯著性差異代謝物有5個,分別是氧化物三甲胺, 精氨酸, 溶血性磷脂酰膽堿, 甜菜堿, 乙酰肉堿。其中梅毒患者的氧化物三甲胺是健康對照組的3.922倍,其可作為梅毒患者與健康者的代謝診斷標(biāo)志物。

圖4

04、通路分析

KEGG通路分析表明,代謝產(chǎn)物主要參與甘油磷脂代謝、膽堿代謝和ABC轉(zhuǎn)運(yùn)體。

圖5

05、結(jié)果

本研究首次通過非靶代謝組學(xué),揭示了梅毒患者與健康者在代謝層面存在者明顯差異,氧化物三甲胺可作為梅毒患者的診斷標(biāo)志物。

小編心得

新穎的研究樣本和方向或許是這篇文章發(fā)表在JCR 2區(qū)的原因之一。后期作者一方面可以用大樣本隊列驗證氧化物三甲胺的診斷能力,另一方面也可以從異常的代謝通路出發(fā),結(jié)合蛋白組、轉(zhuǎn)錄組做更加深入的機(jī)制研究。

中科新生命早在2014年推出了代謝組學(xué)服務(wù),是市面上最早提供代謝組學(xué)服務(wù)的平臺之一,2700+代謝物標(biāo)品二級譜圖數(shù)據(jù)庫+人工二次確認(rèn),雙重保障定性結(jié)果,歡迎有檢測需求的老師前來咨詢。

發(fā)布者:上海中科新生命生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-54665263
E-mail:marketing@aptbiotech.com

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