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云序客戶13分頂級文章,揭示糖尿病血小板來源miRNA參與海綿機制介導動脈損傷修復

瀏覽次數:3364 發布日期:2019-3-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
文章導讀
血管平滑肌細胞(VSMC)在健康狀態下處于去分化表型,在其受損時,循環系統中的血小板快速激活,通過凝血反應為受傷部位止血,同時對創傷部位釋放PDGF、血栓烷等生物活性介質,使VSMC切換為高分化表型,同時細胞處于促增殖狀態。血管內膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化狀態切換機制失調引起的。然而,這類疾病的分子機制還不清楚。
云序生物攜手廣州市婦女兒童醫療中心科研團隊首次揭示血小板中miR-223通過調控靶基因表達從而介導創傷修復過程,同時建立了糖尿病分子機制模型,為日后細胞損傷修復過程提供了參考依據。
發表期刊:Journal of Clinical Investigation
影響因子:13.3
實驗方法:AGO2 RIP實驗miRNA測序
實驗材料:VSMC與血小板共培養組(實驗組),VSMC未處理組(空白組);模型小鼠等
研究內容
1.活化血小板促進人類VSMC分化增殖
首先,本篇文章作者以人類VSMC與活化血小板共培養的細胞為實驗組(AP),未做處理的細胞為空白對照組(RP),進行qPCR和WB檢測,結果顯示共培養組細胞內與分化相關的marker顯著表達,同時細胞增殖能力減弱,這與常理相反。接著,作者從體外和體內角度分別借助共聚焦顯微鏡觀測到VSMC能夠分泌血小板。那么問題來了,血小板是否會攜帶其他分子動態的參與到分化過程呢?
   
圖1. 分化相關蛋白WB結果;共聚焦顯微鏡觀測VSMC能夠自主分泌血小板
2.血小板攜帶miRNA進入VSMC并參與分化過程
帶著前面的問題,作者通過查閱文獻,了解到前人曾經報道過血小板中富含大量的miRNA。那是否是由于血小板中的miRNA參與了細胞的分化呢?接下來的實驗就變的簡單了,借助高通量miRNA測序手段(云序生物miRNA測序服務)對比共培養細胞和未處理組細胞中差異表達的miRNA。測序結果檢測到3個與研究顯著相關的miRNA:分別為miR-223和miR-143/145。借助miRNA定量PCR驗證,發現三者都在共培養細胞中高表達,其中miR-223在共培養8h時高表達,miR-143/145在共培養24h時高表達。那知道了這三者在時間軸上的表達模式,它們發揮了什么樣的機制呢?于是,作者借助AGO2 RIP實驗云序生物提供此項服務)在實驗組中拉取與AGO2蛋白直接結合的miRNA,通過miRNA 定量PCR,證實以上三個miRNA能夠直接與AGO2蛋白結合,參與了海綿機制,并且也證實血小板分泌的miRNA的確是起活性的。
          
圖2. miRNA高通量測序聚類圖;
miRNA定量PCR表明三者在共培養細胞中差異高表達

圖3. AGO2 RIP-miRNA 定量PCR證實以上三個miRNA參與了海綿機制
3.miR-223的靶基因為PDGFRβ
通過生信分析,預測與miRNA結合力最強的靶基因:KLF4,KLF5和PDGFRβ。當然,前面都是推測,作者通過熒光素酶實驗證實兩者是直接結合關系。接下來,作者主要研究了miR-223和PDGFRβ的關系。對靶基因PDGFRβ進行定量PCR后,發現其在受傷股動脈中高表達,證明創傷能使其表達量發生變化。并且,與miR-223表達量成反比。綜上,說明PDGFRβ的確是miR-223靶基因。

圖4. 生信分析預測miRNA和靶基因(3’UTR區)結合
   
圖5. 熒光定量證實miRNA和靶基因的表達量呈負相關
 
4.miR-223在糖尿病小鼠中低表達并促進血管內膜增生
VSMC分化失常主要會使人患上血管增生型糖尿病,因此作者希望通過分子手段研究miR-223在糖尿病中發揮的機制。miRNA定量PCR結果顯示,miR-223不管在人還是小鼠的糖尿病組中都是低表達的模式。那miR-223在細胞中的定位是如何的呢?通過熒光原位雜交,作者發現糖尿病患者的血小板也被內化到VSMC中。因此推測,血小板內化至細胞后,引起血小板內部miR-223的低表達,從而促進了miRNA靶基因在體內的高表達,最終導致血管平滑肌細胞增殖和內膜增生的表型。


圖5. 熒光定量證實miRNA不管在人源還是鼠源都在糖尿病組中低表達;與靶基因的表達成反比;
miRNA低表達促進糖尿病患者血管內膜增生
5.構建VSMC損傷修復模型
作者首次提出VSMC損傷修復機制模型,機制的參與成員主要包括VSMC、內皮組織和血小板,如下圖所示。在未受傷個體中,內皮組織完整,VSMC和血小板間無相互作用。當受損時,內皮屏障受損,血小板活化,一方面釋放PDGF,TXA2等物質,另一方面攜帶miRNA進入VSMC中,提高靶基因的表達,從而促進細胞分化,抑制血管內膜增生。但當糖尿病患者受損傷時,血小板在釋放促修復物質方面與前者一致,但在分子機制上與普通損傷機制上截然相反。

圖6. 正常和糖尿病組中血小板通過運輸miRNA參與VSMC功能
總結:
本篇文章作者首先將血小板和VSMC共培養,發現細胞分化情況與常理相反的現象。由此推測血小板中的miRNA在起作用。推斷依據是:1. 觀測到血小板是由VSMC內化而來。2. 前人研究發現血小板中含有大量miRNA,為證實推測結果,作者通過miRNA高通量測序技術快速找出可能起作用的miR-223,并通過AGO2 RIP實驗證實miR-223參與了海綿機制。借助生信預測,驗證和熒光素酶實驗,找出了靶基因PDGFRβ。最后,推測出VSMC損傷修復的模型以及糖尿病模型中,作者發現了相反的機制,為今后臨床研究帶來了巨大的幫助。云序優勢總結
優勢總結:
值得一提的是,云序生物不僅僅為廣大科研用戶解決測序問題,更提供了機制解決手段。迄今為止,完成RIP和RNA pull down實驗達到100+案例,助力廣大科研工作者沖刺高分文章。
 
 
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