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細(xì)胞螢光素酶的載體選擇、報(bào)告基因檢測(cè)影響因素及常見問(wèn)題解決辦法

瀏覽次數(shù):798 發(fā)布日期:2024-5-8  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

細(xì)胞螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè)受多種因素影響,例如載體狀態(tài),細(xì)胞狀態(tài),轉(zhuǎn)染量,轉(zhuǎn)染效率,裂解效率,加樣精度等等,因此實(shí)驗(yàn)中一般需要做3個(gè)或以上復(fù)孔,且最好采用雙螢光素酶報(bào)告基因,以保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可信度。現(xiàn)將雙螢光素酶實(shí)驗(yàn)檢測(cè)中常見的問(wèn)題匯總?cè)缦拢?br />  

Q1:如何選擇載體?

螢火蟲螢光素酶一般選取pGL-3、pGL-4或pmirGLO的載體,也可自己構(gòu)建相應(yīng)的載體;

 

 


海腎螢光素酶一般選取phRL-TK或pGL-4載體,建議不使用強(qiáng)啟動(dòng)子(如SV40,CMV),而選取中等強(qiáng)度的啟動(dòng)子
 

Q2:檢測(cè)結(jié)果螢光值過(guò)低或無(wú)螢光值怎么辦?

多種情況均可導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果螢光值過(guò)低或無(wú)螢光,具體原因和解決辦法如下:


1,啟動(dòng)子活性低

a.優(yōu)化細(xì)胞的培養(yǎng)條件,提高螢光素酶的表達(dá)量;

b.更換強(qiáng)啟動(dòng)子(如SV40、CMV)。


2,轉(zhuǎn)染效率低

a.優(yōu)化轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)條件,用較易轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒做陽(yáng)性對(duì)照(如轉(zhuǎn)染過(guò)表達(dá)螢光蛋白質(zhì)粒);

b.確保轉(zhuǎn)染DNA的質(zhì)量,可通過(guò)酶切或瓊脂糖凝膠電泳的方法對(duì)DNA質(zhì)量進(jìn)行鑒定;

c.選擇活性較高,處于指數(shù)分裂期的細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染。


3,樣品裂解效率低

a.細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng),12-36h內(nèi)最好,長(zhǎng)時(shí)間培養(yǎng)后,細(xì)胞可能會(huì)難裂解;

b.加入的裂解液需足量,保證細(xì)胞能夠充分裂解。


4,檢測(cè)過(guò)程操作不規(guī)范

a. 選擇合適的檢測(cè)儀器,如Luminometer 發(fā)光計(jì)、多功能酶標(biāo)儀或者其他能夠檢測(cè)生物發(fā)光的儀器都適用于該實(shí)驗(yàn);

b.需加入足量底物,保證底物的飽和,否則會(huì)造成檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)很大偏差;

c.保證室溫反應(yīng)。酶促反應(yīng)對(duì)溫度較為敏感,反應(yīng)時(shí)各個(gè)組分(細(xì)胞裂解產(chǎn)物,底物工作液等)都需要調(diào)整到室溫(20-25℃)再使用;

d.螢光素酶的體外半衰期一般約30min,加完底物后可立即檢測(cè),盡量在30min內(nèi)完成;

e. 檢測(cè)板:為防止孔間干擾,推薦使用不透光白色酶標(biāo)板。黑色酶標(biāo)板也可用,但因黑色會(huì)吸收光信號(hào),可能會(huì)降低信號(hào)。


5,底物氧化失效

a.底物避光密封保存,螢火蟲螢光素酶底物-20℃保存;海腎螢光素酶底物推薦-80℃保存;

b. 反應(yīng)工作液建議現(xiàn)用現(xiàn)配。


Q3:如何判斷轉(zhuǎn)染成功?

1,如轉(zhuǎn)入的miRNA帶螢光標(biāo)記如GFP,則可直接在轉(zhuǎn)染后、細(xì)胞裂解前,顯微鏡下觀察細(xì)胞螢光;

2,如轉(zhuǎn)入的miRNA不帶任何螢光標(biāo)記,可考慮進(jìn)行miRNA的qRT-PCR檢測(cè),通過(guò)檢測(cè)結(jié)果判斷實(shí)驗(yàn)組2、4、6是否相對(duì)其對(duì)照組miRNA有顯著過(guò)表達(dá);

3,設(shè)置一個(gè)螢光質(zhì)粒轉(zhuǎn)染參照組,同批轉(zhuǎn)染一個(gè)組的細(xì)胞,間接反映出同批次實(shí)驗(yàn)的轉(zhuǎn)染情況。


Q4:細(xì)胞裂解物可以存放多久?

常溫一般不超過(guò)6小時(shí),-20℃可以保存一個(gè)月,-80℃可以保存半年。


Q5:螢光素酶作為報(bào)告基因相比于螢光蛋白有哪些優(yōu)勢(shì)?

螢光素酶的靈敏度相比于GFP提高10-100倍以上,同時(shí)具有更寬的動(dòng)態(tài)范圍,便于數(shù)值分析比較,不需要螢光顯微鏡,而且在活體實(shí)驗(yàn)中其螢光穿透性高于GFP等螢光蛋白,同時(shí)由于沒(méi)有內(nèi)源活性、其本底信號(hào)很低。而GFP等螢光蛋白相比于螢光素酶的優(yōu)勢(shì)在于可以進(jìn)行示蹤定位,并且其觀測(cè)不需裂解細(xì)胞,方便進(jìn)行適時(shí)觀察。


Q6:為什么我的實(shí)驗(yàn)復(fù)孔無(wú)法重復(fù)?

實(shí)驗(yàn)復(fù)孔有一定差異是正常的,通常只要在一個(gè)數(shù)量級(jí)之內(nèi)即可。如果差異超出這個(gè)范圍,則需要考慮以下2個(gè)方面,一是細(xì)胞裂解后離心取上清,保證樣本均一性;二是保證加樣的準(zhǔn)確性,移液器要定期校準(zhǔn),確保移液精準(zhǔn)。


Q7:檢測(cè)結(jié)果螢光值越高越好么?

螢光值過(guò)高可能會(huì)超出儀器檢測(cè)范圍從而檢測(cè)不到結(jié)果,一般讀數(shù)在5-6之間較好,螢光值過(guò)高可通過(guò)減少質(zhì)粒轉(zhuǎn)染量或?qū)α呀猱a(chǎn)物進(jìn)行稀釋后檢測(cè),不建議通過(guò)減少螢光底物來(lái)降低螢光值,因?yàn)榈孜镲柡筒拍芊从澄灩馑孛刚鎸?shí)的表達(dá)水平,否則會(huì)造成檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)大的偏差。


螢光素酶實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用

螢光素酶作為報(bào)告基因技術(shù)的一種,具有快速、靈敏、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn),常應(yīng)用于以下幾種生物學(xué)研究:

1,啟動(dòng)子活性分析:?jiǎn)?dòng)子區(qū)是RNA聚合酶的結(jié)合區(qū),啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)直接關(guān)系到轉(zhuǎn)錄的效率,螢光素酶實(shí)驗(yàn)可用于驗(yàn)證待測(cè)啟動(dòng)子是否有活性及其活性區(qū)域;也可實(shí)現(xiàn)組織特異性啟動(dòng)子篩選及確定;以及用于新順式作用元件發(fā)現(xiàn)及功能鑒定。

2,啟動(dòng)子與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合驗(yàn)證:將待檢測(cè)的啟動(dòng)子序列構(gòu)建在報(bào)告基因上游,同時(shí)在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中共表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子,分析螢光素酶表達(dá)水平,即反映轉(zhuǎn)錄因子是否調(diào)控基因的表達(dá),轉(zhuǎn)錄因子能增強(qiáng)或抑制啟動(dòng)子的啟動(dòng)能力。

3,驗(yàn)證microRNA與靶基因是否存在調(diào)控關(guān)系:microRNA主要通過(guò)作用于靶基因的3’UTR起作用,microRNA大部分通過(guò)成熟體種子區(qū)與3’UTR結(jié)合抑制蛋白翻譯。可以將目的基因3’UTR區(qū)域構(gòu)建至報(bào)告基因luciferase的下游,再共轉(zhuǎn)入microRNA,如果螢光素酶表達(dá)下降,可以說(shuō)明microRNA對(duì)目的基因的抑制作用;

4,啟動(dòng)子SNP分析:?jiǎn)蝹(gè)核苷酸變異,簡(jiǎn)稱SNP,通過(guò)構(gòu)建螢光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)研究SNP位點(diǎn)的增強(qiáng)子與轉(zhuǎn)錄因子是否結(jié)合最為直接。

5,分析信號(hào)通路是否激活:將待檢測(cè)信號(hào)通路的下游相應(yīng)元件序列構(gòu)建入報(bào)告基因載體,檢測(cè)不同上游條件下,其螢光素酶活性,即下游信號(hào)通路的響應(yīng)情況。

發(fā)布者:上海瑋馳儀器有限公司
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