胰腺癌(PDA)是一種致命的惡性腫瘤,5年生存率為11%。由于胰腺癌中存在廣泛的腫瘤微環境(TME),即便使用最新的免疫療法,患者的最終治愈率依然低下。先前的報道顯示,胰導管腺癌的發生與WNT信號的激活有關,但是信號通路的激活與腫瘤微環境之間的調控關系尚不清楚。來自美國密歇根大學的研究團隊在Journal of Experimental Medicine(IF 17.579)上發表題為“WNT signaling in the tumor microenvironment promotes immunosuppression in murine pancreatic cancer”的文章。該文章應用單細胞轉錄組測序技術對胰腺癌樣本進行檢測,系統的解析了表達Tcf7的CD4+T細胞通過調控腫瘤微環境的改變,引起PD-L1+細胞的代償性增加。然后,作者在動物模型中,使用WNT信號抑制劑聯合靶向PD-L1治療方案,成功降低了胰腺癌的生長。這一研究成果也為臨床治療胰腺癌提供了新的指導方案。
研究材料
16個樣本的PDA患者單細胞轉錄組數據集(PDA組織和配對的血液樣本)
3個樣本的小鼠的單細胞轉錄組(組織樣本)
技術路線
步驟1:單細胞轉錄組驗證了Tcf7在人和小鼠PDA的CD4+ T細胞中的保守性;
步驟2:敲除Tcf7可以通過抑制CD4+T細胞的免疫功能改變腫瘤微環境;
步驟3:敲除Tcf7可以調控PD-L1+髓細胞細胞代償性的增加;
步驟4:實驗驗證了抑制WNT信號通路對PDA的治療效果。
研究結果
1. 單細胞轉錄組驗證了Tcf7在人和小鼠PDA的CD4+ T細胞中的保守性
為了了解WNT通路在胰腺中的表達情況,作者選擇了課題組先前發表的臨床PDA組織的單細胞數據集進行分析。然后在單細胞的結果上展示了WNT通路中基因的表達水平,結果顯示Tcf7基因(編碼TCF1蛋白)在CD4+T細胞中表達量最高。并且在這16個PDA患者配對的PBMC樣本中展示出了同樣的現象。為了確定Tcf7的表達模式具有物種保守性,作者又選擇了3只小鼠(healthy=2,mPDA=1)進行單細胞測序,通過數據分析共鑒定出了15種細胞類型。進一步分析顯示,相比較健康的小鼠,Tcf7基因在mPDA模型CD4+T細胞中表達的水平更高。這一結果與患者樣本的單細胞數據結果相吻合。
圖1 Tcf7在人和小鼠PDA的CD4+ T細胞中普遍存在
2. 敲除Tcf7可以通過抑制CD4+T細胞的免疫功能改變腫瘤微環境
TCF1最初被認為是T淋巴細胞特異性轉錄因子,在T細胞的發育和分化中起著關鍵作用。因此,基于單細胞的數據分析結果,作者設想TCF1在PDA中具有調節CD4+ T細胞的免疫抑制功能。接下來,作者設計了Tcf7敲除模型。經過一段時間培養后,發現敲除小鼠的腫瘤生長顯著降低。通過IHC和流式分選等實驗進一步驗證了CD4+ T細胞的免疫抑制功能可能由TCF1介導。上述的實驗結果顯示出了Tcf7在調控CD4+T細胞改變腫瘤微環境的重要作用。
圖2 CD4+ T細胞中的TCF1信號通路介導其免疫抑制潛能
接下來,作者設計了對應的Tcf7敲除模型小鼠進行單細胞測序。分析結果顯示Tcf7在CD4+T細胞中的表達水平最高。為了探索Tcf7失活后T細胞的變化,作者對Cd3e表達細胞進行了亞群再聚類分析,并確定了11個不同的cluster。進一步的比較分析顯示了在Tcf7缺失模型組中,Treg細胞顯著減少,而Th17細胞顯著增加。隨后,作者通過實驗驗證了這一結論,從而,揭示了Tcf7的失活抑制Treg細胞分化,促進Th17細胞分化的作用。
圖3 CD4+ T細胞中的TCF1信號通路促進PDA中的Treg分化
3. 敲除Tcf7可以調控PD-L1+髓細胞細胞代償性的增加
接下來,為了確定CD4+ T細胞中Tcf7的失活是否改變了PDA TME中髓系細胞的組成,作者對髓系細胞進行了亞群再聚類,共鑒定出6種細胞類型,發現不同的細胞在兩組模型中的變化顯著。然后作者研究了髓系細胞免疫抑制的潛力,然而不同的髓系細胞亞群在兩組間的Cd274(PD-L1)表達水平相似,但是Arg1和Nos2的表達水平在敲除組中更高。這些結果提示了敲除Tcf7導致了免疫抑制表型增強。這一結果與作者之前觀測到的結果相吻合。隨后,作者通過質譜流(CyTOF)技術再次驗證了這一結果,同時發現在CyTOF的結果中,Tcf7敲除組的PD-L1的髓系細胞數量增加。因此,作者推測PD-L1+細胞的增加是否可以作為治療胰腺癌的靶點。
圖4 CD4+ T細胞中TCF1的缺失導致MDSCs的代償性增加
先前的報道顯示,在一些腫瘤中存在IL-17與PD-L1的表達相關。因此,作者在骨髓來源的髓系前體細胞(BMDMs)上測試了IL-17是否調節PD-L1的表達。結果發現,IL-17A會導致Cd274、Arg1和Nos2的高表達。然而這一結果卻沒能在PDA模型的細胞系中重現。隨后,作者設計了細胞共培養實驗,證實了TCF1缺失的CD4+ T細胞能夠誘導腫瘤細胞中PD-L1的表達。
圖5 CD4+ T細胞中TCF1的缺失驅動髓細胞和腫瘤細胞中PD-L1的表達
4. 實驗驗證了抑制WNT信號對PDA的治療效果
作者先前的數據表明了WNT通路在上皮細胞中參與對腫瘤的支持作用。作者設計使用能夠抑制WNT信號通路的PORCN抑制劑(PORCNi),將小鼠隨機分為對照組或PORCNi組。結果發現PORCNi治療后的小鼠腫瘤更小。然后,作者通過流式細胞術評估了WNT信號的抑制作用是否改變了腫瘤的微環境。結果觀察到在PORCNi治療后的小鼠中Total T細胞和CD8+ T細胞浸潤的增加。隨后,作者又通過抗CD8和抗PD-L1進行功能驗證,發現抑制WNT信號可以使PDA對PD-L1阻斷敏感,表明聯合靶向可以降低胰腺癌的生長,并可能有益于胰腺癌的治療。
圖6 抑制WNT信號可以提高了PD-L1阻斷的療效
小編小結
作者在先前大量的研究中報道了WNT信號在上皮細胞和CD4+ T細胞中具有活性,并有助于阻斷CD8+ T細胞的抗腫瘤活性。因此,在本次研究內容中,作者采用單細胞轉錄組測序技術對PDA患者和模型小鼠的胰腺癌腫瘤組織進行檢測,詳細的描述了CD4+ T細胞中Tcf7的失活以特異性的方式抑制WNT信號,從而激活 CD8+ T細胞效應功能來抑制腫瘤進展。但是表達PD-L1的腫瘤細胞和髓系細胞的數量也得到代償性增加。通過藥物抑制在腫瘤細胞和CD4+ T細胞中抑制WNT信號,聯合PD-L1治療可以有效抑制腫瘤生長。這一研究成果或許可以為胰腺癌的臨床治療提供新的解決方案。
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