“質譜血漿蛋白質組”+“三角法”實現生物標志物開發
瀏覽次數:1425 發布日期:2022-11-14
來源:中科新生命
三角法介紹
傳統的“
三角法”旨在于小隊列中發現大量候選的生物標志物,然后在更大的驗證隊列中進行下一步的驗證和確證,隊列數量從少到多,而篩選的蛋白質標志物的數量從數百或數千減少到只有少數幾個,具體步驟如下。
文章:A pipeline that integrates the discovery and verification of plasma protein biomarkers reveals candidate markers for cardiovascular disease
期刊:nature biotechnology
影響因子:68.164
研究背景:截至當時,使用蛋白質組學鑒定的蛋白質生物標志物僅停留在科研階段,尚未被應用于臨床。
內容簡介:開發了一個整合蛋白質組學技術的研究路徑,從血漿生物標志物的發現到驗證,并將其應用于臨床,作為識別PMI患者心臟損傷的早期生物標志物。在受控心肌損傷的不同階段,從患者心臟中采集血液,以確保候選生物標志物的富集,并允許患者作為自己的生物對照。LC-MS/MS分析檢測到121個高度差異表達的蛋白,包括先前證實的心血管疾病標志物和>100個心肌梗死(MI)的新候選生物標志物。通過對外周血漿樣本進行靶向質譜檢測,來篩選候選標志物。通過PRM或免疫分析,對不同組別(對照組和PMI/自發性MI患者)的外周血漿進行分析,表明候選生物標志物可能是MI的特異性標志物。
技術路線:
文章:Plasma Proteomics Identify Biomarkers and Pathogenesis of COVID-19
期刊:immunity
影響因子:43.474
研究背景:2019冠狀病毒(COVID-19)大流行是一場全球公共衛生危機。然而,對COVID-19的發病機制和生物標志物知之甚少。
內容簡介:通過對新冠肺炎病亡、重癥、輕癥患者的血漿蛋白質組學進行系統性分析,揭示了不同臨床結局患者的血漿蛋白質在疾病進展的不同階段發生了大量獨特的變化。此外,基于機器學習,獲得了用于預測患者不同臨床結局的11種蛋白標志物,并通過獨立隊列進行驗證和確證。
技術路線:
小編小結
“三角法”+“血液質譜蛋白質組學”強強聯合,目前已可對血液蛋白質組進行深度檢測,并獲得有效、科學的生物標志物,有望實現臨床科研的轉化,再次推進國內精準醫療的進程。
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