文章導讀
外泌體是指包含多種RNA(環狀RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白質的盤狀囊泡(30-200nm)。幾乎所有類型的細胞均可分泌外泌體,且外泌體天然存在于各種體液中,包括血液、唾液、尿液、腦脊液和乳汁等。外泌體被視為特異性分泌的膜泡,能夠參與細胞間通訊。目前,有關外泌體分泌、攝取、內容物以及相應功能的精確分子機制的研究才剛剛起步,對外泌體的研究興趣也是日益增長。
2020年2月6日,外泌體領域大牛Raghu Kalluri教授在Science雜志(影響因子41.037)發表了關于外泌體的綜述,該綜述介紹了外泌體的生物發生、異質性、以及細胞間通信過程,同時也分析總結了外泌體在哺乳動物的繁殖和發育、神經退行性疾病、代謝和心血管疾病、免疫反應和感染、癌癥以及在臨床診斷和治療應用等領域中的重要價值,激發了該領域的研究熱度。2020年1月2日,The Journal of Clinical Investigation雜志(影響因子12.282)刊登了一篇外泌體lncRNA LNMAT2促進膀胱癌淋巴轉移過程的文章。該篇文章巧妙利用多種技術揭示了外泌體lncRNA介導的淋巴轉移機制,并將LNMAT2作為膀胱癌淋巴轉移的治療靶點。

發表期刊:The Journal of Clinical Investigation
影響因子:12.282
實驗方法:LncRNA-seq、RNA pull-down+MS/WB、RIP、ChIP、雙熒光素酶報告實驗(云序可提供以上服務)
實驗樣本:淋巴轉移膀胱癌組織vs.非淋巴轉移膀胱癌組織(5 vs. 5 )
文獻鏈接:
https://www.jci.org/articles/view/130892/pdf
文章內容
(1)LNMAT2過表達與BCa淋巴結轉移相關
作者前期通過對5對淋巴轉移膀胱癌組織(LN+)和非淋巴轉移膀胱癌組織(LN-)進行
LncRNA-seq(云序可提供此服務)發現,LNMAT2在淋巴轉移膀胱癌(Bca)組織明顯上調;對266名膀胱癌組織進行qPCR,結果顯示LNMAT2在LN+中明顯上調;K-M分析顯示,LNMAT2過表達的膀胱癌病人生存率(OS)和無病生存率(DFS)明顯少于低表達LNMAT2組。這些數據說明LNMAT2過表達可能引起BCa的LN轉移。

圖注:LNMAT2過表達與BCa淋巴結轉移相關
(2)LNMAT2在BCa細胞分泌的外泌體中富集
作者利用ISH實驗發現,在BCa的胞外間隙中有較高的LNMAT2表達(D);與LN(-)-BCa組織相比,LN(+)-BCa組織中細胞外LNMAT2的表達明顯升高。細胞外lncRNA主要被包裹在特定的亞細胞物質中(特別是外泌體),提示LNMAT2可能被BCa細胞外泌體包裹。為了驗證這一假設,作者從206例BCa患者和120例健康對照組的尿液樣本中分離出外泌體并進行qPCR實驗,發現與健康對照組相比,來自BCa患者的尿液外泌體中LNMAT2表達上調。這提示外泌體LNMAT2對BCa的發生發展有重要意義。

圖注:LNMAT2在BCa細胞分泌的外泌體中富集
(3)BCa細胞分泌的外泌體LNMAT2在體外促進淋巴生成
作者首先對BCa細胞系(5637和UM-UC-3)進行外泌體鑒定;下調/過表達LNMAT2的BCa細胞系外泌體與人淋巴內皮細胞(HLEC)共孵育,血管形成實驗和遷移實驗發現下調LNMAT2能夠抑制HLEC的血管形成和遷移,上調LNMAT2則相反;體內實驗證明,上調LNMAT2能促進淋巴生成。

圖注:BCa細胞分泌的外泌體LNMAT2在體外促進淋巴生成
(4)hnRNPA2B1介導LNMAT2包裝進入BCa細胞外泌體
為了探究LNMAT2的分子機制,作者進行LNMAT2
RNA pull-down+MS(云序可提供此服務)實驗,結果顯示hnRNPA2B1能夠與LNMAT2直接結合;為了驗證MS結果,作者進行LNMAT2
RNA pull-down+WB、RIP+qPCR(云序可提供此服務)實驗,結果顯示LNMAT2確實能夠與hnRNPA2B1直接結合;而且FISH實驗顯示LNMAT2和hnRNPA2B1能夠定位于細胞核;為了探究LNMAT2是如何進入BCa細胞外泌體的,作者在BCa細胞系中敲減hnRNPA2B,發現外泌體中LNMAT2的表達降低。這些結果說明hnRNPA2B1能夠介導LNMAT2包裝進入BCa細胞外泌體。
圖注:hnRNPA2B1介導LNMAT2包裝進入BCa細胞外泌體
(5)外泌體LNMAT2上調PROX1的表達
有研究報道,PROX1通過調節內皮細胞的分化和轉移,對淋巴管系統發育至關重要。因此作者通過qPCR和WB實驗發現,HLECs中上調LNMAT2能夠促進PROX1的表達;為了探究LNMAT2調控PROX1表達的分子機制,作者進行核質分離PCR,發現LNMAT2主要存在于HLECs的細胞核中;為了探究LNMAT2是否參與啟動子區結合,作者針對PROX1上游-2000 bp到下游+200bp分區間進行雙熒光素酶報告實驗(云序可提供此服務),結果顯示PROX1在-650bp到-350bp區間的熒光值明顯升高,說明該區域能夠與LNMAT2結合。

圖注:外泌體LNMAT2上調PROX1的表達
(6)外泌體LNMAT2與hnRNPA2B1互作促進PROX1啟動子區H3K4三甲基化
研究發現,hnRNPA2B1能夠通過與目標DNA結合參與H3K4三甲基化(H3K4me3)相關的表觀遺傳調控。為了探究hnRNPA2B1是否也具有類似功能,作者通過
ChIP實驗(云序可提供此服務)驗證,在LNMAT2過表達的HLECs中,hnRNPA2B1與H3K4me3都與PROX1啟動區結合能力增強,反之亦然;這說明外泌體LNMAT2通過與hnRNPA2B1直接互作提高PROX1啟動子中H3K4me3的水平。

圖注:外泌體LNMAT2與hnRNPA2B1互作促進PROX1啟動子區H3K4三甲基化
(7)外泌體LNMAT2誘導PROX1上調促進淋巴淋巴轉移
為了明確PROX1是否為BCa外泌體LNMAT2誘導淋巴管生成所必需的,作者進行了PROX1挽救實驗,發現PROX1過表達能夠回補外泌體LNMAT2過表達導致的抑制HLEC血管形成和遷移現象;相反,PROX1沉默明顯消除了外泌體LNMAT2誘導的HLEC血管形成和遷移現象。


圖注:外泌體LNMAT2誘導PROX1上調促進淋巴轉移
(8)外泌體LNMAT2與BCa患者的淋巴結轉移有關
研究證明,BCa細胞分泌的外泌體lncRNA可以在尿液中檢測到,并且這些尿液外泌體lncRNA被認為可以作為早期診斷BCa的生物標志物,作者對另外206例BCa患者尿液外泌體進行qPCR,結果顯示LNMAT2在LN(+)BCa中明顯上調;KM分析顯示尿液外泌體LNMAT2高表達BCa患者的OS 和DFS是降低的;ROC曲線分析顯示尿外泌體LNMAT2可以作為BCa和LN(+)BCa診斷的生物分子標志物。

圖注:外泌體LNMAT2與BCa患者的淋巴結轉移有關
總結
總體來說,該研究通過
LncRNA-seq(云序可提供此服務)篩選了在淋巴轉移的膀胱癌中上調的LNMAT2,并通過原位雜交實驗將LNMAT2與膀胱癌外泌體聯系在一起,并巧妙利用了
RNA pull-down+MS/WB、RIP、ChIP以及雙熒光素酶報告實驗等方法
(云序可提供以上服務),探究hnRNPA2B1介導LNMAT2進入膀胱癌外泌體中,外泌體LNMAT2被人淋巴管內皮細胞攝取內化后,通過募集hnRNPA2B1和增加PROX1啟動子上的H3K4三甲基化水平,進一步上調PROX1表達,最終導致淋巴管生成和淋巴轉移。這為研究和理解生物體復雜的外泌體調控機制,提供了比較完整的實驗研究思路和方案,具有很強的理論先導性和示范性,也為疾病的調控和靶點提供了重要的理論依據。
圖注:膀胱癌外泌體LNMAT2調控淋巴轉移的分子機制
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