Scienion點樣儀二月文獻速遞匯總閱讀
關于 SCIENION
SCIENION是一家在超低液量噴點技術方面優越的全球性設備制造商。適合將寡核苷酸，蛋白質，抗體和聚糖等試劑裝載到生物芯片或相關診斷器械上。Scienion的點樣儀有著高效、精確的點樣能力和解決方案，可以顯著提升這項研究的實驗設計和結果的可靠性，提高實驗效率和數據質量，從而推動臨床診斷工具的發展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文獻鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
這篇文章主要探討了蛋白質選擇性（即蛋白質如何區分優選和非優選配體）的機制，特別是通過研究人類轉錄因子MAX的變異體如何影響DNA序列的特異性和選擇性。研究的核心目標是揭示影響轉錄因子對DNA結合選擇性的生物物理機制，這對預測生物功能和蛋白質工程具有重要意義。研究結果強調了構象異質性在決定序列選擇性方面的重要性，并為未來的選擇性蛋白質工程提供了指導。這些結果突顯了構象異質性在決定序列選擇性方面的重要性，并可指導未來設計選擇性蛋白質的工作。
02
文獻鏈接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
這篇文章研究了硫酸軟骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化對其與血管內皮生長因子（VEGF-A）和成纖維生長因子2（FGF-2）結合的影響，旨在探討CS在抗腫瘤血管生成中的作用及其機制。
通過將糖鏈微陣列與計算模型相結合，研究揭示了CS的結構與其與促血管生成因子相互作用之間的關系。研究結果表明，在設計抗血管生成藥物時，應考慮CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。總體而言，這項研究為理解CS的生物學功能提供了新的見解，并為開發更有效的抗血管生成藥物提供了理論基礎。
03
文獻鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
這篇文章主要討論了宮頸癌的預防、檢測和診斷，特別是在資源有限的環境中面臨的挑戰。盡管宮頸癌可以通過篩查和治療宮頸癌前期病變來預防，但在低收入和中等收入國家（LMICs）中，宮頸癌的負擔仍然很高，部分原因是缺乏負擔得起且易于使用的篩查和診斷測試。
研究還展示了該測試在細胞樣本中的臨床相關檢測下限，并通過一項小型試點研究（n=19）驗證了其臨床性能，結果顯示該紙基HPV E7測試在與宮頸上皮內瘤變等級2或以上（CIN2+）的組織病理學診斷相比時，準確率高達95%。文章最后提到，通過進一步的臨床驗證，這種檢測方法可以實現高度特異性的宮頸癌前病變和癌癥的床旁檢測，無需儀器，價格低廉，非常適合在資源有限的環境中使用。總體而言，這項研究為宮頸癌的早期檢測提供了一種創新的、可行的解決方案，旨在減少資源有限地區的疾病負擔。
04
文獻鏈接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文獻鏈接打開可能需連接 VPN
這篇文章主要介紹了一種新的微流控平臺——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解決蛋白質折疊過程中對動力學穩定性測量的挑戰。文章指出，盡管蛋白質在折疊后會短暫地采樣未折疊或部分未折疊的中間體，這些中間體往往容易發生不可逆的改變（如蛋白水解、聚集或后翻譯修飾），并且動力學穩定性除了熱力學穩定性之外，還會直接影響蛋白質的壽命、豐度以及形成替代的、可能破壞性的狀態。文章展示了SPARKfold的能力和潛力，通過并行測定1,104個蛋白樣本的展開速率常數。通過SPARKfold比較突變對動力學效應的影響，并結合之前發表的折疊熱力學測量，研究者獲取了關于折疊過渡態和路徑的信息。未來的研究中，SPARKfold可以揭示驅動錯誤折疊和聚集的突變，并促進對在惡劣環境中工業應用的動力學超穩定變體的理性設計。
05
文獻下載鏈接：
https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
這篇文章主要研究了外泌體(extracellular vesicles, EVs)在細胞受到細胞毒性環境影響時的特征，特別是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)這種多環芳烴下的情況。文章強調了EVs作為生物標志物在多種疾病和治療應用中的潛力，并提供了對來自人類微血管內皮細胞(HMEC-1)產生的10K EVs的深入表征。結果表明，B[a]P暴露可能導致EV的大小增加和標記物表達的變化，指示在細胞毒性壓力下EV的表型發生了轉變。這項研究強調了SPRi 和 AFM 在鑒定與細胞毒性反應相關的EV標記物方面的作用，為了解 EV的異質性提供了深刻見解。
06
文獻鏈接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
這篇文章主要研究了植物細胞壁在植物免疫中的作用，特別是細胞壁衍生分子（如損傷相關分子模式，DAMPs）在免疫信號傳導中的潛力。雖然已知來自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他細胞壁成分的免疫信號潛力仍然沒有得到充分探討。此研究還鑒定了與ARM受體相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖結構，并發現ARM受體在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法為發現植物中的糖類-受體配對提供了一個強大的平臺，拓展了對植物免疫機制的理解。
SCIENION是一家在超低液量噴點技術方面優越的全球性設備制造商。適合將寡核苷酸，蛋白質，抗體和聚糖等試劑裝載到生物芯片或相關診斷器械上。Scienion的點樣儀有著高效、精確的點樣能力和解決方案，可以顯著提升這項研究的實驗設計和結果的可靠性，提高實驗效率和數據質量，從而推動臨床診斷工具的發展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文獻鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
這篇文章主要探討了蛋白質選擇性（即蛋白質如何區分優選和非優選配體）的機制，特別是通過研究人類轉錄因子MAX的變異體如何影響DNA序列的特異性和選擇性。研究的核心目標是揭示影響轉錄因子對DNA結合選擇性的生物物理機制，這對預測生物功能和蛋白質工程具有重要意義。研究結果強調了構象異質性在決定序列選擇性方面的重要性，并為未來的選擇性蛋白質工程提供了指導。這些結果突顯了構象異質性在決定序列選擇性方面的重要性，并可指導未來設計選擇性蛋白質的工作。
02
文獻鏈接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
這篇文章研究了硫酸軟骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化對其與血管內皮生長因子（VEGF-A）和成纖維生長因子2（FGF-2）結合的影響，旨在探討CS在抗腫瘤血管生成中的作用及其機制。
通過將糖鏈微陣列與計算模型相結合，研究揭示了CS的結構與其與促血管生成因子相互作用之間的關系。研究結果表明，在設計抗血管生成藥物時，應考慮CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。總體而言，這項研究為理解CS的生物學功能提供了新的見解，并為開發更有效的抗血管生成藥物提供了理論基礎。
03
文獻鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
這篇文章主要討論了宮頸癌的預防、檢測和診斷，特別是在資源有限的環境中面臨的挑戰。盡管宮頸癌可以通過篩查和治療宮頸癌前期病變來預防，但在低收入和中等收入國家（LMICs）中，宮頸癌的負擔仍然很高，部分原因是缺乏負擔得起且易于使用的篩查和診斷測試。
研究還展示了該測試在細胞樣本中的臨床相關檢測下限，并通過一項小型試點研究（n=19）驗證了其臨床性能，結果顯示該紙基HPV E7測試在與宮頸上皮內瘤變等級2或以上（CIN2+）的組織病理學診斷相比時，準確率高達95%。文章最后提到，通過進一步的臨床驗證，這種檢測方法可以實現高度特異性的宮頸癌前病變和癌癥的床旁檢測，無需儀器，價格低廉，非常適合在資源有限的環境中使用。總體而言，這項研究為宮頸癌的早期檢測提供了一種創新的、可行的解決方案，旨在減少資源有限地區的疾病負擔。
04
文獻鏈接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文獻鏈接打開可能需連接 VPN
這篇文章主要介紹了一種新的微流控平臺——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解決蛋白質折疊過程中對動力學穩定性測量的挑戰。文章指出，盡管蛋白質在折疊后會短暫地采樣未折疊或部分未折疊的中間體，這些中間體往往容易發生不可逆的改變（如蛋白水解、聚集或后翻譯修飾），并且動力學穩定性除了熱力學穩定性之外，還會直接影響蛋白質的壽命、豐度以及形成替代的、可能破壞性的狀態。文章展示了SPARKfold的能力和潛力，通過并行測定1,104個蛋白樣本的展開速率常數。通過SPARKfold比較突變對動力學效應的影響，并結合之前發表的折疊熱力學測量，研究者獲取了關于折疊過渡態和路徑的信息。未來的研究中，SPARKfold可以揭示驅動錯誤折疊和聚集的突變，并促進對在惡劣環境中工業應用的動力學超穩定變體的理性設計。
05
文獻下載鏈接：
https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
這篇文章主要研究了外泌體(extracellular vesicles, EVs)在細胞受到細胞毒性環境影響時的特征，特別是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)這種多環芳烴下的情況。文章強調了EVs作為生物標志物在多種疾病和治療應用中的潛力，并提供了對來自人類微血管內皮細胞(HMEC-1)產生的10K EVs的深入表征。結果表明，B[a]P暴露可能導致EV的大小增加和標記物表達的變化，指示在細胞毒性壓力下EV的表型發生了轉變。這項研究強調了SPRi 和 AFM 在鑒定與細胞毒性反應相關的EV標記物方面的作用，為了解 EV的異質性提供了深刻見解。
06
文獻鏈接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
這篇文章主要研究了植物細胞壁在植物免疫中的作用，特別是細胞壁衍生分子（如損傷相關分子模式，DAMPs）在免疫信號傳導中的潛力。雖然已知來自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他細胞壁成分的免疫信號潛力仍然沒有得到充分探討。此研究還鑒定了與ARM受體相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖結構，并發現ARM受體在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法為發現植物中的糖類-受體配對提供了一個強大的平臺，拓展了對植物免疫機制的理解。
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