蛋白標記定量(Protein Labeling Quantification)是一種用于分析蛋白質表達和調控的實驗技術,蛋白質在實驗中會與特定的標記分子結合,旨在量化分析特定蛋白質或多個蛋白質在不同樣品中的表達水平。
蛋白標記定量的關鍵步驟通常包括:
1、蛋白質提取:
首先從研究的生物樣本(如細胞、組織或體液)中提取蛋白質。
2、蛋白質標記:
將蛋白質與化學標簽或同位素標簽結合。這些標簽可以是穩定同位素標記(如SILAC)、同位素標記的氨基酸(如iTRAQ)或其他特定的化學標記物。這些標記允許研究人員在后續分析中區分和量化不同樣本中的相同蛋白質。
圖1. 使用SILAC進行蛋白質定量(Esthelle et al.,2019)
3、蛋白質分離與鑒定:
通過液相色譜(LC)、二維凝膠電泳(2D-PAGE)等技術將蛋白質分離。之后,通常使用質譜(MS)技術對標記的蛋白質進行鑒定和定量。
4、數據分析:
利用生物信息學工具對獲得的數據進行分析,比較不同樣本或處理條件下的蛋白質表達差異。
圖2. SIALC與Dimethyl標記法對比
蛋白標記定量服務在生物醫學研究、藥物開發、疾病診斷等領域有廣泛的應用,特別是在研究蛋白質如何在不同條件下表達和調控方面。通過定量分析蛋白質的表達,研究人員可以更好地了解疾病的機理,發現潛在的生物標記物,或評估藥物的效果。