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煙臺海岸帶所利用蛋白組+磷酸化修飾組學(xué)揭示TDCIPP毒理機制

瀏覽次數(shù):1838 發(fā)布日期:2022-9-23  來源:中科新生命

 

磷酸三(1,3-二氯-2-丙基)酯 (TDCIPP)是一種典型的有機磷污染物,在水環(huán)境中廣泛存在。先前研究表明,TDCIPP通過蛋白磷酸化來發(fā)揮多重毒性,但是其中機理尚不明確。

2022年7月15日,國際頂尖環(huán)境科學(xué)期刊Journal of Hazardous Materials(IF 14.224)在線發(fā)表了中科院煙臺海岸帶研究所吉成龍等老師的創(chuàng)新研究成果“Toxicological effects of tris(1,3-dichloro-2-propyl) phosphate in oyster Crassostrea gigas using proteomic and phosphoproteomic analyses”。該研究采用蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化修飾組學(xué),結(jié)合傳統(tǒng)方法對不同濃度TDCIPP處理的牡蠣進行毒理效應(yīng)研究。組學(xué)分析顯示,TDCIPP通過直接磷酸化關(guān)鍵蛋白或上游信號通路來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄、能量代謝、細胞凋亡和增殖,讓我們對TDCIPP的毒理機制有了新的認識。中科新生命提供了蛋白質(zhì)組磷酸化修飾組檢測服務(wù)。
 


研究材料

牡蠣
 

技術(shù)路線

步驟1:TDCIPP生物濃度;

步驟2:消化腺組織學(xué)變化;

步驟3:關(guān)鍵酶活性檢測;

步驟4:蛋白質(zhì)組學(xué)分析;

步驟5:磷酸化修飾組學(xué)分析。


研究結(jié)果

1. TDCIPP生物濃度

與對照組相比,5和50 μg/L TDCIPP處理組牡蠣中TDCIPP含量顯著積累 (圖1)。


圖1 不同處理組牡蠣的TDCIPP積累

 

2. 消化腺組織學(xué)變化

H&E染色顯示對照組消化管腔呈十字形,消化細胞高,管腔窄,消化管上皮厚。TDCIPP處理組的上皮細胞較薄,管腔較寬,消化管管腔由十字形變?yōu)閳A形,最高濃度(50 μg/L)處理組的消化細胞發(fā)生脫落(圖2)
 

圖2 牡蠣消化腺的石蠟切片


隨著TDCIPP劑量的增加,消化管MLR/MET比值增加,其中50 μg/L TDCIPP處理組的牡蠣樣品MLR/MET值最高;5 μg/L TDCIPP處理組次之(圖3)


圖3 不同處理組消化腺MLR/MET值

 

3.  關(guān)鍵酶活性檢測

CAT和GST活性在對照組和TDCIPP暴露組間無顯著差異。AChE的活性呈底部變化。在caspase-9活性方面,只有50 μg/L TDCIPP處理組顯著高于對照組。與對照組相比,TDCIPP治療組caspase-3活性無顯著變化(圖4)。


圖4 TDCIPP暴露后消化腺的酶活性

 

4. 蛋白質(zhì)組學(xué)分析

從牡蠣消化腺樣本中共鑒定出6705個蛋白質(zhì)。與對照組相比,50 μg/L TDCIPP處理組的牡蠣共有551個差異表達的蛋白質(zhì)(DEPs),其中上調(diào)蛋白259個,下調(diào)蛋白292個。GO富集分析發(fā)現(xiàn)(圖5A),大多數(shù)DEPs位于細胞內(nèi)(74),參與代謝過程(147)和細胞過程(114),分子功能主要集中在催化活性(168)和結(jié)合活性(131)。KEGG通路分析顯示(圖5B),上調(diào)的注釋蛋白在脂類和氨基酸的代謝過程中富集,下調(diào)的注釋蛋白在三個Hippo信號通路等中富集。其中,谷胱甘肽代謝通路覆蓋最多DEPs(8);最顯著富集通路是維生素B6代謝;其他富集的KEGG通路與代謝過程有關(guān)。


圖5 50μg/L TDCIPP處理的消化腺中DEPs的GO富集柱狀圖(A)和KEGG通路富集氣泡圖(B)

 

5. 磷酸化修飾組學(xué)分析

在牡蠣消化腺中,共鑒定出850個磷酸化蛋白,152個蛋白被差異磷酸化。GO分析顯示(圖6A),在生物過程中,富集程度最高的是含蛋白復(fù)合體和細胞含蛋白復(fù)合體。大多數(shù)DPPs的分子功能是核酸結(jié)合(21)。細胞成分大多位于蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合體(3)、DNA包裝復(fù)合體(3)和核小體(3)中。KEGG通路分析顯示(圖6B),在MAPK信號通路、病灶黏附和TCA循環(huán)中,磷酸化蛋白高度富集。在50 μg/L TDCIPP處理組中,病灶粘連通路覆蓋的DPPs最多(5)。最顯著富集通路的是丙酮酸代謝。其他的富集通路參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和能量代謝通路。將鑒定的DEPs與DPPs進行比較,發(fā)現(xiàn)在兩者間并未出現(xiàn)重疊蛋白,但KEGG分析表明,在TDCIPP處理后,DEPs和DPPs都參與了信號通路。


圖6 50 μg/L TDCIPP處理的消化腺中DPPs的GO富集柱狀圖(A)和KEGG通路富集氣泡圖(B)

 

小編小結(jié)

本研究利用蛋白質(zhì)組學(xué)+磷酸化修飾組學(xué),結(jié)合生化數(shù)據(jù)和組織學(xué)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)TDCIPP具有刺激性神經(jīng)毒素,會破壞細胞凋亡與細胞增殖之間的內(nèi)部穩(wěn)態(tài)。高濃度的TDCIPP可通過直接磷酸化關(guān)鍵蛋白或其上游信號通路導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄、能量代謝、細胞凋亡和增殖等過程發(fā)生異常。

發(fā)布者:上海中科新生命生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-54665263
E-mail:marketing@aptbiotech.com

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