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細胞分選和分離等單細胞技術研究方向及應用介紹

瀏覽次數(shù):1842 發(fā)布日期:2022-7-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
單細胞技術研究方向介紹
細胞探索和檢查是生物學研究的基礎。然而,生物學知識的主要數(shù)量源于研究細胞群的傳統(tǒng)方法,而不是生物學最基本的單位,即單個細胞。在這種格式中,假設細胞群在物理特征上是同質的,基因組表達和平均測量值通常會掩蓋單細胞差異 。從本質上講,生物學的許多關鍵領域需要只能在單細胞水平上解決的研究,例如干細胞分化和疾病進展。據(jù)計算,在前 5 次人類合子后分裂期間,每個細胞每次分裂大約有 1.3 個突變。衰老和神經(jīng)退行性變期間體細胞突變增加。單細胞技術研究方向是什么?生物和物理技術的改進推進了單細胞研究,并為這些領域和許多其他領域提供了新的見解,這些領域可能產(chǎn)生更大的影響。在單細胞探索水平上,可以看到和分類許多差異。隨著該領域的發(fā)展,這些差異已被證明是生理和生物過程的催化劑以及調節(jié)劑 。



技術和分析技術的進步一直是單細胞領域的推動力 。以前的理論現(xiàn)在可以及時且具有成本效益的方式進行測試。成像技術允許通過熒光二級標記的陡峭性質進行更大范圍的分類,現(xiàn)在將 GFP 和其他特征轉染到細胞系中很常見。這種轉染現(xiàn)在可以通過病毒標記在單細胞水平上實現(xiàn)。

雖然大多數(shù)單細胞技術需要分離或分離單個細胞,但組合條形碼可以直接作用于細胞池。有時,分離細胞核而不是細胞并進行進一步分析,例如單核 RNA-seq以盡量減少來自其他細胞的任何污染或全神經(jīng)元解離或激光字幕顯微解剖遇到的降解。

單細胞技術及應用
技術 應用 相關數(shù)據(jù)
 
FACS
微型筏

 
分類和隔離  
分離細胞以進行其他相關技術分析
根據(jù)目標標記對細胞進行分類以進行分組和可能的分析

 
 
1D 跟蹤
Fibrillar
Microfluidics
傳統(tǒng) - 單細胞
3D

 
細胞運動  
遷移率、持久性和出租車研究
可以分析細胞粘附和表型
3D 平行原生環(huán)境

 
生物傳感器 生化分析 監(jiān)測與生理過程相關的結合相互作用
 
支柱
微接觸印刷

 
細胞牽引力 對細胞運動至關重要的機械數(shù)據(jù)
 
RT-qPCR
RNA FISH
TIVA
質譜

 
基因組分析  
基因表達譜
一些技術的空間信息

 
表 1。單細胞技術、應用和相關生成數(shù)據(jù)。

單細胞研究的一個主要限制是確保可以對大量生成的數(shù)據(jù)進行邏輯和成功的分析。在單細胞蛋白質組和基因組分析中尤其如此。隨著技術的不斷完善,以系統(tǒng)和有意義的方式全面解釋數(shù)據(jù)的能力將變得至關重要。通過圖像采集監(jiān)測單個細胞正在迅速增加研究人員可用的實驗方法。開源和專有軟件可以編譯大量圖像并生成全面的延時圖像,從而使更復雜的技術變得易于重現(xiàn)。表 1 顯示了當前使用的一些關鍵方法,以及對產(chǎn)生的相關數(shù)據(jù)和相關生物學研究領域的解釋。
 
技術 優(yōu)點 缺點
流式細胞儀  
高通量
可以同時篩選多個標記
成熟的技術

 
 
需要大量細胞群,這需要細胞通過傳代生長
高流速會損壞細胞
不適合所有細胞類型

 
微型筏  
需要少量
細胞 可以研究所有細胞類型

 
 
需要特殊設施才能產(chǎn)生
有限的標記篩選

 
表 2。細胞分選和分離技術的比較。

單細胞分析-流式細胞技術和微筏陣列技術
單個細胞通常可以在顯微鏡下手動拾取 。除了手動方法,特定的排序方法是單細胞策略的關鍵組成部分。微流體技術的進步極大地提高了這些方法的通量,將能夠分析的細胞數(shù)量增加到相關水平。熒光激活細胞分選 (FACS) 是一種成熟的方法,適用于廣泛的應用。然而,新的微打印方法,如微筏陣列正在迅速為該領域做出貢獻,并且似乎是當前的主選方法。

FACS是流式細胞儀的流行工具。它成為生物學中的一種標準工具,用于分選具有現(xiàn)成來源的不同單克隆抗體的活細胞。抗體與熒光團連接,并在細胞懸液中篩選所需的標記。通過激光對細胞進行分類,以根據(jù)抗體的結合測量熒光特性,并將其分類為相應的類別。流速在FACS 中至關重要,以確保在任何給定時間只有一個細胞通過激光。可用的不同熒光團的數(shù)量限制了可以在任何時候篩選的參數(shù)數(shù)量。通過 FACS 對 NeuN 染色的細胞進行分類是單神經(jīng)元研究的常用方法 。多種標記和染料可用于對具有獨特標記表達的細胞進行分類。例如,B Shen 等人通過多種標記物分離出骨髓造血細胞和脾細胞。
微型筏是微米大小的孔,當細胞分離物流過它們時,平均存在零個或一個細胞。附著方法可以是磁性的、聚苯乙烯的或生物的 ,并將細胞牢固地固定在適當?shù)奈恢谩T谧R別出感興趣的細胞后,可以使用微針或其他類似技術將細胞與微筏一起移出。尺寸通常在數(shù)千口井中,但如果需要,可以擴展到數(shù)百萬甚至更多。

微筏陣列已被用于對具有高存活率的貼壁細胞進行分類以進行植入。相對于 FACS,微筏陣列不需要高細胞群或流速;這兩者都可能導致細胞表型的變異。因此,它是所有細胞類型(包括脆弱細胞)的可行選擇。此外,它是干細胞和原代細胞系的理想選擇,因為達到適當濃度所需的傳代次數(shù)較少,可防止對多能性、基因表達和表型異質性造成不可逆的改變 。分類后,微筏陣列還可以通過充當微載體來幫助植入傷口愈合和再生應用。微載體的使用已被證明可以增加肝臟、心臟和肺組織的愈合,而微筏有助于篩選貼壁細胞,這是有效植入所需的。

微流體,例如液滴微流體 Fluidigm C1 系統(tǒng)或 10X 基因組學系統(tǒng)  ,也是分離單細胞的重要工具。
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發(fā)布者:蘇州阿爾法生物實驗器材有限公司
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