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根據樣本選擇適當濃縮離心管的方法及其應用

瀏覽次數:2339 發布日期:2022-1-18  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
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如何選擇合適的濃縮離心管?
 

一提起蛋白質濃縮、更換緩沖液,我們都會想起超濾。這是一種我們都很熟悉的膜分離技術。它可用來分離溶液中極小的顆粒和溶解的分子。這種方法的最大特點是操作簡便,只需要濃縮離心管和離心機,即可圓滿完成我們的任務。

 

與層析、透析等方法相比,超濾對被處理的分子更加溫和。它不需要有機萃取,就不會導致蛋白變性。這種方法非常高效,可同時濃縮和純化分子。操作可在低溫(比如冷庫)下進行。另外,快速、便宜,也是許多人青睞它的原因。

 

濃縮離心管的操作很簡單。選擇適當的濃縮離心管,加入待處理的樣本,按照離心管的指示進行離心操作,最后回收截留的樣本。在離心力的作用下,溶液中的小分子溶質和溶劑透過超濾膜,被收集在濾過液收集瓶中,而大分子溶質被超濾膜截留在濃縮離心管中。這種分離的主要依據是分子大小,但分子形狀和電荷等其他因素也會有影響。

 

一般來說,超濾的回收率可達90%以上。樣本損失大多是由于濾膜表面和容器表面的非特異性吸附引起的。因此,選擇口碑好、高品質的濃縮離心管非常重要。頗爾作為全球最大的過濾企業,提供了多種濃縮離心管,可對50 μl到60 ml的樣本進行高效的濃縮和脫鹽。它配備了Omega(改良的聚醚砜)膜,確保低的非特異性吸附和高的回收率。當然,這個的前提是你選對了濃縮離心管。

 

如何選擇濃縮離心管?

 

1、按體積

 
 

頗爾公司實驗室提供了4個系列的濃縮離心管,適合處理不同體積的樣本。你可以根據你的樣本量來選擇。不過,如果樣本濃度低體積大,可以選擇較小容積的濃縮離心管多次重復加樣離心。

 
樣品 樣本體積
Nanosep® 濃縮離心管 < 0.5 mL
Microsep Advance 濃縮離心管 0.5-5.0 mL
Macrosep® Advance 濃縮離心管 5-20 mL
Jumbosep 濃縮離心管 20-60 mL
 

2、選擇適當的截留分子量(MWCO)

 
 

一旦樣本體積確定,下一步就是選擇適當的MWCO。對于蛋白質而言,建議所選濾膜的MWCO是欲截留分子大小的1/6-1/3。通常,截留孔徑越小,流速越慢,但截留比例更大。因此,如果流速是主要的考慮因素,建議選擇MWCO為1/3的濾膜;如果重點考慮截留比例,那么最好選擇更致密的膜。

 

友情提示一下,超濾膜對分子的截留是由多個因素決定的。在截留分子量之外,你還有必要考慮分子形狀、電荷、樣本濃度、樣本組成及操作條件。也許,線性的DNA分子溜走了,而球狀的分子卻被保留下來。總之,根據下表來選擇MWCO就基本沒錯了。為了防止大家拿錯管子,頗爾實驗室還貼心地將不同MWCO的濃縮離心管設置成不同的顏色,以方便識別。

 

核酸應用的MWCO選擇

 
MWCO 堿基對(雙鏈) 堿基(單鏈)
3K 16-32 bp 32-65 bs
5K 25-50 bp 50-95 bs
10K 50-145 bp 95-285 bs
30K 145-285 bp 285-570 bs
50K 240-475 bp 475-950 bs
100K 475-1450 bp 950-2900 bs
300K 1450-2900 bp 2900-5700 bs
1000K 4800-9500 bp > 9500 bs
 

蛋白應用的MWCO選擇

 
MWCO 膜額定的孔徑大小 生物分子的大小 生物分子的分子量
3K - - 10K-20K
5K - - 15K-30K
10K - - 30K-90K
30K - - 90K-180K
50K 5 nm 15-30 nm 150K-300K
100K 10 nm 30-90 nm 300K-900K
300K 35 nm 90-200 nm 900K-1800K
1000K 100 nm 300-600 nm > 3000K
 

濃縮離心管的應用

 

濃縮

 
 

這是大家都很熟悉的應用。超濾可很方便地濃縮經過稀釋的蛋白質或DNA/RNA樣本。它很溫和,不會打斷長達100 kb的DNA,也不會導致蛋白酶活的損失,同時也很高效,回收率通常高于90%。

 

脫鹽和緩沖液交換

 
 

超濾帶來了一種方便而高效的方法,可去除和交換溶液中的鹽、去除變性劑、分離復合分子、去除低分子量組分,或者快速改變離子或者pH環境。比如在用兩種或兩種以上的限制性內切酶進行酶切時,有時找不到通用的酶切緩沖液,就可以借助濃縮離心管,更換緩沖液。

 

組分分離

 
 

當然,超濾無法完全分離兩種分子量接近的分子。為了有效分離,待分離分子的分子量至少要相差一個數量級(10X)。對于PCR產物的純化和回收,超濾就很適合。PCR反應混合物里含有多種鹽、游離的核酸、甘油、蛋白和引物,因此大多數的下游應用都要求對PCR產物進行某種純化。超濾的方法快速,操作少,產率高,也不損傷DNA。

 

最后提醒一下,濃縮離心管是一次性的工具,不建議重復使用。頗爾實驗室可以為您降低成本,為您的科研保駕護航。

 
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