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鼠疫桿菌(YP)核酸檢測試劑盒說明書

瀏覽次數(shù):3269 發(fā)布日期:2021-2-5  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負
鼠疫桿菌(YP)核酸檢測試劑盒說明書

技術(shù)原理:
DNA的半保留復(fù)制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動子的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復(fù)制成同樣的兩分子挎貝。

在聚合酶鏈式反應(yīng)實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,并設(shè)計引物做啟動子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。( DNA高溫變性低溫復(fù)性)

發(fā)現(xiàn)耐熱DNA聚合同酶--Taq酶對于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時也大大降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。

特點優(yōu)勢:
.特異性:所有產(chǎn)品使用的引物均經(jīng)過詳盡的生物信息學(xué)分析,經(jīng)過GenBank及自建龐大數(shù)據(jù)庫的比對,確保所用的每一條引物均為種屬或血清型特異的基因序列區(qū)段,可實現(xiàn)對細菌種屬及血清型的特異檢測,特異性均達到00%。

2.   重現(xiàn)性:該系列所有產(chǎn)品均經(jīng)過大量實驗菌株的驗證,重現(xiàn)性為00%。

3.   靈敏性:該系列產(chǎn)品可實現(xiàn)對檢測菌的高靈敏檢測,當樣品中細菌的濃度達到03cfu/ml時,可實現(xiàn)對其的直接檢測,無需繁瑣的增菌過程。

4.   實用性:檢測范圍廣,涵蓋了對人體危害較為嚴重的7種呼吸道及腸道致病菌,可實現(xiàn)對臨床樣品及其他環(huán)境取樣的快速檢測,整個檢測過程為3-4個小時。

5.   優(yōu)勢:序列資源豐富,除GenBank公布的序列外,公司還進行了大量菌株的序列破譯,從理論上保證所選引物具有良好的保守性和特異性。

6.   優(yōu)勢2:該系列試劑盒均經(jīng)過大量的保守性及特異性實驗驗證,憑借公司擁有的豐富的菌種資源,每一種檢測試劑盒均經(jīng)過了20余種標準菌株和臨床菌株的保守性驗證及40余種近緣標準菌株和臨床菌株的特異性驗證,確保在使用過程中不會出現(xiàn)任何的假陽性及假陰性報告結(jié)果。

需要自備的器材:
.方法儀器:分析天平、離心機、熒光 PCR 擴增儀、組織研磨器、-20 ℃冰箱、可調(diào)移液器(2 µL、20
µL、200 µL、000 µL)。
2.耗材:熒光 PCR 專用反應(yīng)管、眼科剪、眼科鑷、生理鹽水、.5 mL 經(jīng)焦碳酸二乙酯(DEPC)水
處理的滅菌離心管、吸頭(0 µL、200 µL、000 µL)、滅菌雙蒸水。
樣本采集、存放及運輸:
、樣本采集:各類型樣本按照常規(guī)方法采集;
2、存放:樣本在2~8℃條件下保存應(yīng)不超過72h,-70℃以下可長期保存,但應(yīng)避免反復(fù)凍融(zui多凍融3次);
3、運輸:采用泡沫箱加冰密封進行運輸。

組成及試劑配制:
、酶標板:一塊(96孔)
 
2、 標準品(凍干品): 2瓶,請臨用前5分鐘內(nèi)配制。每瓶以樣品稀釋液稀釋至0.5ml,蓋好后室溫靜置大約0分鐘,同時反復(fù)顛倒/搓動以助溶解,其濃度為200 U/L,然后做系列倍比稀釋(注:不要直接在板中進行倍比稀釋),分別配制成200 U/L,00 U/L,50 U/L,25 U/L,2.5 U/L,6.25 U/L,3.2 U/L,樣品稀釋液直接作為空白孔 0 U/L。如配制00 U/L標準品:取0.3ml (不要少于0.3ml )200 U/L的上述標準品加入含有0.3ml樣品稀釋液的Eppendorf管中,混勻即可,其余濃度以此類推。
 
3、 樣品稀釋液:×20ml。
 
4、 檢測稀釋液A:×0ml。
 
5、 檢測稀釋液B:×0ml。   

反應(yīng)五要素:
參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設(shè)計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。設(shè)計引物應(yīng)遵循以下原則:
 
①引物長度: 5-30bp,常用為20bp左右。
 
②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至0kb的片段。
 
③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC*隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
 
④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴增條帶。
 
⑤引物3'端的堿基,特別是最末及倒數(shù)第二個堿基,應(yīng)嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。
 
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列*有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。
 
⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。
 
引物量:每條引物的濃度0.~umol或0~00pmol,以*引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。PCR實驗步驟:
①產(chǎn)品僅用于科研取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。
②兩相分離 每ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的lvfang,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體5秒后,5到30℃孵育2到3分鐘。4℃下2000rpm離心5分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色酚lvfang相,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時加入的TRIZOL試劑的60%。

③RNA沉淀 將水相上層轉(zhuǎn)移到一干凈無RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉淀其中的RNA,混勻后5到30℃孵育0分鐘后,于4℃下2000rpm 離心0分鐘。此時離心前不可見的RNA沉淀將在管底部和側(cè)壁上形成膠狀沉淀塊。

④RNA清洗 移去上清液,每mlTRIZOL試劑裂解的樣品中加入至少ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀;靹蚝,4℃下7000rpm離心5分鐘。

⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室溫空氣中干燥5-0分鐘。

⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA時,先加入無RNA酶的水40μl用槍反復(fù)吹打幾次,使其完全溶解,獲得的RNA溶液保存于-80℃待用。 )紫外吸收法測定先用稀釋用的TE溶液將分光光度計調(diào)零。然后取少量RNA溶液用TE稀釋(:00)后,讀取其在分光光度計260nm和280nm處的吸收值,測定RNA溶液 濃度和純度。

PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:
.引物與模板DNA特異正確的結(jié)合。
2.堿基配對原則。
3. Tag DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實性。
4.靶基因的特異性與保守性。

其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應(yīng)的忠實性及 Tag DNA聚合醇耐高溫性,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進行,結(jié)合的特異性大大増加加,被擴増的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。

靈敏度高
PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式増加的,能將皮克(pg=0-29)量級的起始待測模板擴増到微克(ug=0-69)水平。能從00萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學(xué)中zu小檢出率為3個細菌。

(3)簡便、快速
PCR反應(yīng)用耐高溫的 Tag DNA聚合酶,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴増液和水浴鍋上進行變性退火-延伸反應(yīng),一般在2-4小時完成擴増反應(yīng)。擴増產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。

(4)對標本的純度要求低
不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及總RNA均可作為擴増模板?芍苯佑门R床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活PCR技術(shù)概論。
 
注意事項:   
 
、使用本試劑前請仔細閱讀本說明書全文。
 
2 、操作時應(yīng)盡量少說話,因口腔中也含有支原體,可能引起樣品污染,而造成假陽性;整個檢測過程中,反應(yīng)體系的配制、樣本處理及加樣、PCR擴增應(yīng)分區(qū)域進行,以避免交叉污染。 
 
3 、實驗時,試劑盒組分中的試劑使用前應(yīng)充分融化并混勻(混勻時禁止激烈振蕩,只需要進行上下倒置多次進行混勻)。
 
4、 反應(yīng)管中加好所有的試劑后,應(yīng)盡快上PCR儀進行擴增,以免形成過多的二聚體。
 
5、細胞培養(yǎng)物中含有青霉素和鏈霉素等抗生物素不會影響本品的檢測結(jié)果。如果用戶需要進一步提高檢測。
 
 
發(fā)布者:上海莼試生物技術(shù)有限公司
聯(lián)系電話:021-60443211
E-mail:3004967995@qq.com

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