液體處理專家如何自動化、標準化捕獲測序文庫制備

瀏覽次數：2070　發布日期：2020-10-10　來源：本站　僅供參考，謝絕轉載，否則責任自負

目標區域捕獲測序技術，是根據已知特定基因組區域序列設計寡核苷酸探針，通過雜交將目標區域捕獲富集進行二代測序。其針對目標區域深度測序，增加了檢查靈敏度和準確性。既滿足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關注。

液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案，幫助您實現自動化、標準化的捕獲測序。由自動化工作站進行基因捕獲，可以減少手工操作時間，提高工作效率，增加結果的重復性和均一性。 Biomek工作站可實現從核酸提取，文庫構建，定量混樣到捕獲的整體實驗流程。

Figure 1. 捕獲測序文庫構建自動化流程

由Biomek成功自動化的雜交捕獲試劑盒：

Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent

Agilent SureSelect XT®

Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input

Illumina Nextera® Rapid Capture

Illumina TruSeq® Exome

Illumina TruSeq® Rapid Exome

Illumina TruSight® Cancer

Illumina TruSight® Tumor 15

Illumina TruSight® Tumor 170

IDT xGen® Exome Research Panel

NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel

Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS

Biomek自動化捕獲測序數據展示

Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。
上圖：片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰；
下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結果。

Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數據vs.
Biomek i7自動化工作站完成數據。A. 平均中靶率，B. 重復率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。

Biomek向導式軟件操作界面

在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數量，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運行工作流程的哪個部分。此外，具備臺面自動校對功能，當操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據攝像頭拍攝，自動判定耗材擺放是否正確，對錯誤擺放位置進行提示。避免由于人為擺放耗材錯誤，導致設備碰撞或試劑、時間損失。