上期小編為大家介紹了以單一看家蛋白作為定量Western Blot內參蛋白的分析方法,這次咱不得不說說以全蛋白為內參的分析方法。
期刊JBC(The Journal of Biological Chemistry)在Western Blot數據要求中指出,對于半定量蛋白表達的實驗,最佳的內參為全蛋白內參,如果以看家蛋白為內參,需要提供其在實驗處理中表達量恒定的實驗證明。
全蛋白作為內參的優勢在于:
1、目標蛋白的相對豐度為目標蛋白強度與全蛋白強度比,不再依賴于單一蛋白強度值。
2、敏感性好。
3、線性范圍寬。
4、蛋白可視化。
5、更適用于低豐度表達蛋白。
如果考慮使用全蛋白作為內參,之前只有兩種方法,一是使用考染膠,平行跑兩塊膠,問題在于很難保證重復性;二是使用麗春紅染料進行印跡膜染色,問題在于穩定差,很難實現全蛋白定量,隨著熒光蛋白染色技術的問世,全蛋白定量問題得以順利解決。
AzureRed全蛋白染色進行歸一化
“總蛋白歸一化”或TPN變得越來越流行,可以避免依賴看家蛋白進行歸一化的許多缺點。在該方法中,將目標蛋白的灰度值與加載在泳道中的總蛋白的灰度值進行比較。TPN比使用單一蛋白作為歸一化更具有優勢,例如不易受樣品之間蛋白變化的影響,不是觀察一種蛋白的強度,而是測量每條泳道的灰度值。由于TPN技術消除了許多與信號歸一化相關的問題,因此發表文章越來越多地要求使用總蛋白信號進行歸一化。
AzureRed熒光蛋白染色是一種用于凝膠和印跡膜的定量總蛋白染色試劑,與下游蛋白分析兼容,包括Western Blot。AzureRed是染色應用的理想選擇,包括轉印后染色以確認從凝膠到膜的蛋白質轉移情況,以及定量蛋白。
AzureRed總蛋白和三個靶標蛋白同時成像
向凝膠中加入稀釋的HeLa細胞裂解物。轉印后,將印跡用AzureRed染色,然后在不脫色情況下加入Tubulin,
ß-actin和GAPDH探針。 用Sapphire 雙模式多光譜激光成像系統掃描成像。四個通道進行疊加,
總蛋白質(AzureRed染色)以灰色顯示;Tubulin-紅色,ß-actin-藍色和GAPDH-綠色。
AzureRed熒光蛋白染色是熒光Western Blot定量的理想選擇。寬廣的線性動態范圍確保AzureRed成為解決蛋白上樣變化的有效標準。AzureRed的一個關鍵特性是將其融入現有Western Blot工作流程的簡單性。
AzureRed染料可與常用熒光探針同時檢測,無干擾,允許在一張印跡膜上檢測多種蛋白質。使用AzureRed可以進行多色印跡的總蛋白歸一化,不需要剝離和重孵育,可以在一張印跡膜上定量多種蛋白。 該方法快速,可以與感興趣蛋白一同成像。有關AzureRed熒光蛋白染色的更多詳細信息,請訪問如下鏈接:www.azurebiosystems.com。
與常見的看家蛋白相比,AzureRed具有更寬的線性動態范圍
單色通道圖像A)AureRed染色總蛋白B)Tubulin C)β-action和D)GAPDH。AzureRed信號的優異動態范圍與實際加載的蛋白量顯示在圖像(A)中。使用AzureSpot軟件定量來自總蛋白和看家蛋白的信號,并將得到的值相對于每個樣品加載的
蛋白量(E)作圖。與常見的看家蛋白相比,AzureRed表現出更強的相關性和更廣泛的動態范圍。
Sapphire配合AzureRed總蛋白熒光染色劑可以做總蛋白歸一化和定量三個靶標蛋白,生成可以信賴的定量Western Blot數據。
Azure300帶有Q模塊,可激發AzureRed等染料進行全蛋白定量,最后化學發光條帶和總蛋白條帶同時在一張膜上成像,滿足Nature,JBC等期刊雜志的總蛋白定量要求,幫助用戶發表文章。
專業的AzureSpot分析軟件
可做AzureRed總蛋白的型號:
SapphireNIR-Q,SapphireRGB,SapphireRGBNIR;Azure300Q,Azure400,Azure500Q,Azure600