染色體外DNA:癌基因竟然不存在于染色體上
瀏覽次數:2459 發布日期:2019-11-22
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昨日,Paul S.Mischel教授團隊在Nature雜志上發表了名為Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression的文章,該文章首次解析了
ecDNA的結構與功能。
那么什么是ecDNA呢?
研究團隊發現,其實
大量的癌基因并不在染色體上,而是會從染色體上脫落下來,變成一種小型的DNA,稱為染色體外DNA(extrachromosomal DNA,簡稱ecDNA)
這種顛覆傳統認知的發現到底意味著什么呢?文章指出ecDNA在腫瘤中普遍存在,同時由于缺乏著絲粒,導致其不遵照孟德爾定律進行遺傳,是驅動腫瘤異質性的重要因素,也是導致腫瘤耐藥性的誘因。這將對腫瘤的治療帶來極大的挑戰。
我們知道,由于腫瘤存在異質性,所以傳統的組織活檢已經不能全面的解析腫瘤的真面目了。隨著技術的發展,液體活檢這一檢測方法逐漸成為檢測癌癥的新手段。液體活檢是指取患者的體液(血液、尿液、腦脊液等),通過測序或者數字PCR等方法對其中的腫瘤標志物進行檢測,從而確定患者是否罹患疾病。
目前,在液體活檢方面做得較為出色的平臺要數來自法國stilla technologies公司的Naica全自動微滴芯片式數字PCR系統了。
該系統是法國stilla公司開發的下一代核酸絕對定量技術。使用cutting-edge微流體創新型芯片——Sapphire芯片作為數字PCR過程的唯一耗材。樣品通過毛細通道網格以30,000個微滴的形式進入2D芯片中,可稱作Crystal微滴。PCR擴增實驗在芯片上實現。對微滴成像用以檢測包含擴增片段的微滴。最后一步是對陽性微滴計數從而得到精準的核酸絕對數量。
該平臺擁有強大的圖像分析技術和直觀可視的檢測功能,從而達到了數字PCR定量卓越的置信水平,獲得的數據真實可信。并且該系統目前為市面上最簡單的數字PCR系統,可以實現3熒光通道檢測的數字PCR平臺,快速建立多重實驗。
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