1.接通電源，確認電壓為220V，高純氮鋼瓶高壓>10公斤，低壓為4.55公斤，特別注意避免虛假低壓。

2.系統、9#瓶、10#瓶、活化腔、反應腔、裝藥空瓶檢漏，下閥壓力為11psi，上閥壓力為3psi。關閉閥門后壓力下降應<0.30psi/3min。裝藥空瓶應注意去除鋁蓋中央的小圓片。

3.裝上合成試劑瓶，注意瓶內試劑是否夠合成用量，密封圈是否合適。使計算機和主機聯系上。

4.測量各合成試劑瓶的流速。調節下閥使各瓶流速符合規定值。最后計算時間修正值T。

5.在計算機上編輯多肽序列，由N端到C端。從ABI Chemistry 中選擇所需的合成方法。計算機存儲后，將這些資料送入主機，并在主機上改正T值。

6.主機自檢后，定標黑色斑馬條紋，定標值應為0-4096。

7.裝上氨基酸藥瓶，瓶鋁蓋中央的小圓鋁片去掉，條碼朝里，檢查排放順序是否符合編輯的多肽序列。

8.多肽合成開始前再復核前面的順序，是否有遺漏。并檢查：廢液瓶是否太滿，鋼瓶高壓、低壓是否合適，上閥、下閥壓力是否正確，濾片是否需更換，閥門開關是否處于press use狀態。

9.按下主機菜單的begin開關，開始多肽合成。合成時室溫為18-25℃。

10.合成完畢后，用9#和10#瓶的溶劑和鋼瓶氮氣沖洗系統。卸下所有的合成試劑瓶，并加蓋密封，換上干凈的空瓶。閥門開關處于Vent位置，再關主機。