真核生物蛋白可以通過與各種小分子物質(zhì)或蛋白質(zhì)相結(jié)合的方式被修飾。在眾多的修飾方式當(dāng)中有一種就是與泛素蛋白或泛素樣蛋白(UBL)相結(jié)合,采用這種抗原肽修飾方法可以對(duì)多種生理過程進(jìn)行調(diào)控。UBL蛋白可以控制被修飾蛋白與其它生物大分子(比如蛋白酶體或染色質(zhì))間的相互作用。各種UBL系統(tǒng)都會(huì)使用相應(yīng)的酶來催化修飾反應(yīng),不過這些修飾反應(yīng)中大部分都是暫時(shí)的。有越來越多的證據(jù)表明這種UBL抗原肽修飾途徑來自原核生物的硫轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(sulphurtransferase system)及相關(guān)酶類。而且,在真核生物的共同祖先中,類似于UBL連接酶和UBL去連接酶的蛋白也是廣泛存在的,這些證據(jù)都說明UBL抗原肽修飾系統(tǒng)不是起源于真核生物。
真核細(xì)胞內(nèi)的蛋白都會(huì)經(jīng)歷各種翻譯后修飾,這些修飾過程極大地?cái)U(kuò)展了蛋白的功能多樣性和動(dòng)力學(xué)多樣性。蛋白可以通過與磷酸基團(tuán)、甲基化基團(tuán)、乙酰基團(tuán)或某些蛋白質(zhì)基團(tuán)(通常這種連接方式都是短暫的)相連接的方式被修飾。而泛素蛋白修飾方式就是上述與蛋白質(zhì)相連的修飾方式中第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的。現(xiàn)在,我們已經(jīng)對(duì)這種修飾途徑研究得非常透徹了。泛素蛋白是一小分子蛋白,它在真核生物界非常保守,但是在真細(xì)菌界(Eubacteria)和古細(xì)菌界(Archaea)都不存在。泛素蛋白還可以與上千種不同的蛋白結(jié)合。
泛素化過程是一個(gè)復(fù)雜的過程(背景知識(shí)框1)。UBL修飾途徑也與泛素化修飾途徑類似。參與UBL修飾途徑的酶雖然各不相同,但在進(jìn)化上都與參與泛素化途徑的酶具有相關(guān)性。由于泛素蛋白與UBL蛋白具有相同的三維核心結(jié)構(gòu)——β-抓握折疊(β-grasp fold)結(jié)構(gòu)——這說明各種不同的UBL修飾系統(tǒng)都源自一個(gè)共同的祖先。