系列講座主題:
主題一:小分子構象分析利器-Mogul 介紹及其在藥物設計中的應用案例
主題二:強大的分子對接軟件GOLD介紹及應用
主題三:利用CCDC軟件進行構象生成及分子疊合
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一、小分子構象分析利器-Mogul 介紹及其在藥物設計中的應用案例
Using Mogul to assess molecular geometry and the use cases in drug design.
時間:7月15日(周五)下午15:00-16:00
藥物設計中,判斷小分子構象的合理性是十分重要的。比如小分子和蛋白結合構象,可能在對接和打分中提示了較強的結合力,但是在真實的實驗中卻沒有活性或者活性較差,其中一部分原因可能是因為對接程序和打分對于分子構象合理性的考慮不足。Mogul 是基于海量小分子晶體結構數據提煉的知識數據庫,利用Mogul可以檢查小分子構象中任何不常見的(unusual)的構象特征,比如不合理的二面角、鍵長及鍵角。本次在線講座將介紹Mogul的功能特性,并用Mogul解釋化合物的SAR數據、篩選合理的Docking 構象以及用于化合物的結構優化。
二、強大的分子對接軟件GOLD介紹及應用
The introduction of GOLD and its advantages.
時間:7月29日(周五)下午14:30-15:30
GOLD 是一款知名的分子對接軟件,憑借CCDC海量的晶體數據GOLD在分子結合構象生成、含有金屬離子參與的體系對接等方面有強大的功能和優勢。本次在線講座將介紹GOLD特點和優勢以及在藥物設計中的應用案例。
三、利用CCDC軟件進行構象生成及分子疊合
Conformer generation and molecular alignment.
時間:8月12日(周五)下午15:00-16:00
CCDC的Discovery 套件提供分子構象生成和疊合算法,通過借助超過100萬的晶體數據庫的知識和理解能夠以極快的速度生成優良的分子構象。