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CNS文章的生信分析培訓班通知

瀏覽次數(shù):2504 發(fā)布日期:2021-12-28  來源:本站 本站原創(chuàng),轉載請注明出處
CNS文章的生信分析怎么做?包教包會學單細胞測序、chipseq、RNAseq、Atacseq、R語言
我們承諾: 1包教會,學不會一直免費學,直到您完全學懂、學會、學透徹為止
2,課后有完善的一對一指導服務,保證解決每個學員的所有問題
2022年1月4日開班 線上課程兩個月 每周二四六晚上三個多小時
 
【課程簡介】
學生信一次報班從此以后再也不用東拼西湊反復報名各類培訓班,
系統(tǒng)學生信,一次學到位,包教包會。
二個月從零基礎開始,精細化講解 將生信內(nèi)容全部學懂(理解)、學會(會敲代碼分析)、學透徹(站在頂層設計角度理解)、學以致用(用到自己的標書申請和文章發(fā)表中)
學不會一直學,直到學會才畢業(yè)
【授課老師】
華哥:中山大學博士 指導過多篇CNS文章生信分析 參與多項國自然重點、國家重大專項、孔雀計劃等項目申報 有多年生信教學經(jīng)驗,學員遍布協(xié)和、華西、湘雅、瑞金、中山醫(yī)等著名醫(yī)院
【課程安排】每周二四六晚上每節(jié)課三個多小時
第一節(jié)課:r語言基礎學習 包括r和rstudio的安裝、環(huán)境配置、數(shù)據(jù)結構等基礎內(nèi)容學習
第二節(jié)課:在實戰(zhàn)中進一步提升對r語言的學習,主要以geo的芯片數(shù)據(jù)下載、整理、分析為主。
第三節(jié)課:芯片數(shù)據(jù)分析(主要系統(tǒng)指導如何使用geo數(shù)據(jù)庫畫生存曲線,以及無進展、無疾病、多分組的的生存曲線畫圖,包括熱圖 火山圖 箱線圖 小提琴圖 )
第四節(jié)課:rnaseq數(shù)據(jù)分析(包括系統(tǒng)講解主流的Deseq2、Edger、limma-voom三種差異分析的方法)
第五節(jié)課:基因集富集分析 gsva gsea kegg go富集 包括自定義基因集的富集分析以兩篇nature子刊文章為例,系統(tǒng)講解如何進行參數(shù)調(diào)整得到符合文章趨勢的富集結果
第六節(jié)課:tcga 數(shù)據(jù)下載 整理 差異分析 結果畫圖展示
第七節(jié)課:非監(jiān)督共識聚類算法系統(tǒng)講解以兩篇cell文章為例 通路分組的生存曲線 轉錄因子富集
第八節(jié)課:wgcna算法系統(tǒng)講解以nature文章為例,系統(tǒng)講解三種免疫浸潤的算法,以及三種算法的具體應用場景和區(qū)別以及參數(shù)調(diào)整技巧
第九節(jié)課 :單細胞數(shù)據(jù)讀取以nature文章為例,創(chuàng)建seurat對象 質(zhì)控 s4對象的數(shù)據(jù)結構的系統(tǒng)講解
第十節(jié)課:繼續(xù)以nature文章為例系統(tǒng)闡釋降維、聚類等概念,細胞亞群注釋三種方法
第十一節(jié)課:多個樣本整合的單細胞數(shù)據(jù)分析 包括錨定和harmony兩種主流的單細胞數(shù)據(jù)整合算法,同時講解多線程運算原理和實操。
第十二節(jié)課:單細胞差異分析 metadata理解 分組添加 可視化畫圖 熱圖 氣泡圖
第十三節(jié)課:以nature文章為例系統(tǒng)auc算法計算通路活性,單細胞差異基因的富集分析 gsea 亞群的gsva  auc 轉錄因子預測
第十四節(jié)課:系統(tǒng)講解擬時間分析 包括monocle2 和monocle3 做3d擬時間
第十五節(jié)課:系統(tǒng)講解scenic算法 轉錄調(diào)控網(wǎng)絡分析
第十六節(jié)課:系統(tǒng)講解cellphonedb、cellchat、italk三種主流分析細胞互作的軟件
第十七節(jié)課:infercnv和以cell文章為例的自定義算法的染色體拷貝數(shù)變異
第十八節(jié)課:單細胞非負矩陣 cnn降維 非共識聚類 以及單細胞的wgcna
第十九節(jié)課:以cell文章為例 系統(tǒng)講解單細胞的RNA velocity應用
第二十節(jié)課:系統(tǒng)學習linux操作系統(tǒng) chipseq全流程分析以nature文章為例 包括質(zhì)控 上數(shù)據(jù)比對 、MACS2、IGV進行可視化
第二十一節(jié)課:chipseq下游的motif富集 不同處理直接的峰值overlap韋恩圖 差異paek尋找 peak注釋 以cell文章為例超級增強子尋找
第二十二節(jié)課:Atacpseq全流程分析包括MappingQC、多個重復樣本合并、Peakcalling、bedGraphToBigWig、TSS Enrichment、bedtools計算overlap、IDR評估、可視化。
第二十三節(jié)課:WES分析、gatk使用、VCF下游分析、annovar注釋
第二十四節(jié)課: 單細胞空間轉錄組的注釋以及可視化
第二十五節(jié)課:以優(yōu)秀標書為例,講解如何將所學生信分析應用于國自然標書申請+課程大總結
 
【主辦單位】
瑋瑜科研平臺(上海瑋瑜生物科技有限公司)
【承辦單位】
上海瑋瑜生物科技有限公司
上海焦務科技服務中心
【培訓時間】
2022年1月4日開始
【注冊費用】
注冊費用:8800元/人
可開會務、注冊、檢測、分析服務等發(fā)票
【繳費賬號】
A:匯款賬戶
戶 名:上海焦務科技服務中心  賬戶號:9734 0078 8012 0000 0311
開 戶 行:上海浦東發(fā)展銀行大華支行 
B:支付寶轉賬
收款人:wybiot@163.com   支付寶戶名:上海瑋瑜生物科技有限公司
C:信用卡或公務卡支付
微信或支付寶掃描二維碼支付,通過信用卡/公務卡扣款
【聯(lián)系人】
聯(lián)系人:謝老師 13611825136     
報名郵箱: wybiot@126.com

參考附件:報名回執(zhí)表

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