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BPRC第五期蛋白質(zhì)組信息學培訓班(第二輪)通知

瀏覽次數(shù):5926 發(fā)布日期:2016-7-13  來源:本站 本站原創(chuàng),轉載請注明出處

北京蛋白質(zhì)組研究中心第五期蛋白質(zhì)組信息學培訓班通知

北京蛋白質(zhì)組研究中心第五期蛋白質(zhì)組信息學培訓班
 
(第二輪通知)
時間:2016年8月2-5日
地點:北京蛋白質(zhì)組研究中心(北京市昌平區(qū)科學園路38號,中關村生命科學園內(nèi))
 
主辦單位
國家蛋白質(zhì)科學中心·北京(鳳凰中心)
北京蛋白質(zhì)組研究中心(BPRC)    
蛋白質(zhì)組學國家重點實驗室(SKLP)
中國生物化學與分子生物學會蛋白質(zhì)組學專業(yè)委員會(CNHUPO)
 
國家蛋白質(zhì)科學中心•北京(簡稱“鳳凰中心”)/北京蛋白質(zhì)組研究中心(BPRC)坐落在國家科技創(chuàng)新示范區(qū)——中關村生命科學園,是我國生命科學領域的國家科技基礎設施,也是國際人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃執(zhí)行總部、蛋白質(zhì)組學國家重點實驗室和首都科技條件平臺。
 
鳳凰中心/BPRC在以院士領銜,入選國家杰青、北京市科技新星為骨干的專家團隊帶領下,在生命科學領域不斷開拓,建立了高通量、高分辨率、高精度的蛋白質(zhì)組學,以高性能“天河”超級計算機為核心的生物信息學,蛋白質(zhì)相互作用,多功能多層次顯微成像,流式分選,模式生物構建,抗體藥物篩選等技術體系與平臺。我們愿與從事生命科學研究的有識之士一起,推動生命科學新發(fā)現(xiàn)、新技術、新產(chǎn)品的涌現(xiàn),實現(xiàn)“創(chuàng)造歷史,引領世界”的夢想。
 
培訓目的
本課程為生命科學研究人員介紹如何合理利用和開發(fā)蛋白質(zhì)生物信息學資源。課程著眼于實際數(shù)據(jù)庫搜索、工具使用、大型數(shù)據(jù)庫分析、生物學網(wǎng)絡構建、可視化和數(shù)據(jù)分析等。采取小班授課,專人指導;理論課與實踐課相結合,講師與學員研討的方式進行;精心挑選相應的上機軟件,提供充足的實際操作機會;讓每位學員學有所成。
 
培訓對象
● 從事生命科學、農(nóng)學、醫(yī)學等領域科研工作者和高校教師及研究生
● 迫切希望提升生物信息分析能力的學者
 
培訓內(nèi)容
質(zhì)譜數(shù)據(jù)深度分析、蛋白質(zhì)注釋及功能分析、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡構建及分析、蛋白質(zhì)組研究主題信息服務和專業(yè)數(shù)據(jù)庫研發(fā)。
 
課程安排
2016年8月2日
主持人:楊 冬 朱偉民
主題:蛋白質(zhì)組信息學  蛋白質(zhì)鑒定
時間
主講人
培訓內(nèi)容
9:00-10:00
講座
朱偉民
● 課程介紹
● 蛋白質(zhì)組學
● 蛋白質(zhì)組信息學工作流程
10:00-10:45
講座
朱偉民
工作流原理
● 序列數(shù)據(jù)庫
● 肽段鑒定
● 蛋白組裝
● 蛋白定量
● 質(zhì)量控制和標準
10:45-11:00
茶歇
11:00-11:45
講座
楊 冬
工作流原理
● 翻譯后修飾
● 數(shù)據(jù)挖掘
● 數(shù)據(jù)注釋
● 聚類和其他分析
11:45-12:30
練習
楊 冬
常用的生物信息數(shù)據(jù)庫和工具
12:30-13:30
午餐
13:30-14:30
講座
楊 冬
Mascot:實踐中的搜索工具
14:30-15:15
練習
楊 冬
搜索工具的環(huán)境
15:15-15:30
茶歇
15:30-16:30
講座
楊 冬
搜索工具實際應用
16:30-17:15
講座
Henning Hermjakob
數(shù)據(jù)存儲與發(fā)布:ProteomeXchange
17:15
結束
2016年8月3日
主持人:朱云平
主題:定量蛋白質(zhì)組
時間
主講人
培訓內(nèi)容
9:00-10:00
講座
常 乘
標記定量蛋白質(zhì)組學:母離子標記方法
10:00-10:45
講座
常 乘
標定定量蛋白質(zhì)組學:子離子標記方法
10:45-11:00
茶歇
11:00-11:45
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
MaxQuant上機練習
11:45-12:30
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
MaxQuant上機練習
12:30-13:30
午餐
13:30-14:30
講座
常 乘
非標定量蛋白質(zhì)組學
14:30-15:15
練習
常 乘
差異表達蛋白的統(tǒng)計分析
15:15-15:30
茶歇
15:30
講座
常 乘
PANDA和PANDA-view介紹
16:30
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
PANDA和PANDA-view上機練習
17:15
結束
2016年8月4日
主持人:馮晉文
主題:工作流  數(shù)據(jù)發(fā)布
時間
主講人
培訓內(nèi)容
9:00
講座
馮晉文
TPP(trans proteome pipeline)數(shù)據(jù)分析平臺介紹
10:00
練習
馮晉文
 
● 基于X!Tandem肽段鑒定
● 基于peptide Prophet肽段驗證
10:45-11:00
茶歇
11:00
練習
馮晉文
蛋白質(zhì)定量
● Libra
蛋白質(zhì)組裝
● Protein Prophet
11:45
練習
馮晉文
實際操作
12:30-13:30
午餐
13:30
講座
馮晉文
Firmiana簡介
14:30
練習
馮晉文
Firmiana上機練習
15:15-15:30
茶歇
15:30
講座
馬 潔
基于Iprox的數(shù)據(jù)存儲
16:30
練習
馬 潔
實際操作:基于Iprox的數(shù)據(jù)存儲
17:15-18:00
參觀Phoenix center
2016年8月5日
主持人:李棟
主題:網(wǎng)絡和通路
時間
主講人
培訓內(nèi)容
9:00
講座
李 棟
蛋白質(zhì)網(wǎng)絡的構建與分析
10:00
講座
李 棟
蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集深度挖掘
10:45
茶歇
11:00
練習
李 棟
網(wǎng)絡工具介紹:
● KEGG, Reactome
● STRING
11:45
練習
李 棟
上機練習
12:30
午餐
13:30
講座
劉中揚
Cytoscape簡介
14:30
練習
劉中揚
Cytoscape上機練習
15:15-15:30
茶歇
15:30-16:30
練習
劉中揚
Cytoscape上機練習
17:15
結束
 
培訓費用
● 即日起至8月1日之間注冊:每人4500元,學生4000元。
● 網(wǎng)上注冊地址:(見下方二維碼)
● 培訓費用包含:培訓資料、培訓期間的午、晚餐。
● 住宿費用自理,請自行聯(lián)系酒店登記住宿信息。
 
報到時間和地點
● 報到:8月1日全天,鳳凰中心/BPRC
● 培訓:8月2-5日,鳳凰中心/BPRC (北京市昌平區(qū)科學園路38號,中關村生命科學園內(nèi))。
● 住宿:北京梧桐苑商務酒店(緊鄰鳳凰中心大樓),預訂電話:010-61777200(預定時請說明參加此次培訓)
● 學員自備筆記本電腦(具有WiFi無線網(wǎng)絡功能)用以操作練習。
 
注意事項
參加本期培訓班的學員可以享受中心提供的技術服務優(yōu)惠政策。技術服務項目請看網(wǎng)站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27 或 http://www.ncpsb.org/cn/%E6%9C%8D%E5%8A%A1
 
匯款信息
帳    號:0200004909200041055
賬戶名稱:北京蛋白質(zhì)組研究中心
開戶銀行:工商銀行北京市永定路支行
注:匯款時請務必注明學員姓名、單位和“信息學培訓班”字樣。匯款后將匯款憑據(jù)傳真至中心,或將掃描電子版發(fā)送至郵箱dw3026@163.com,以確保匯款安全到賬。
如需發(fā)票請注明發(fā)票抬頭,培訓結束后統(tǒng)一開具發(fā)票(培訓費、會議費、技術服務費等)。
 
聯(lián)系方式
聯(lián)系電話:注冊:(010)61777015
          咨詢:(010)61777010
傳    真:(010)61777050
電子郵件:dw3026@163.com
通信地址:北京市昌平區(qū)科學園路38號(102206)
北京蛋白質(zhì)組研究中心第五期蛋白質(zhì)組學培訓班通知
 

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