羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制

瀏覽次數：2834　發布日期：2012-11-22　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制

中國及中亞細亞溫帶荒漠地區的駱駝均為雙峰駱駝(Bactrian camel)，中國的雙峰駝集中分布于內蒙古西部、寧夏、新疆、甘肅的溫帶荒漠和荒漠草原區，占全國總駝數的95%。且中國尚有數量比大熊貓還少的世界珍稀瀕危動物—野生雙峰駝存在。內蒙古阿拉善盟是中國駱駝最多的地區，擁有雙峰駝10萬峰以上，約占全國駱駝總數的33%、世界駱駝總數的25%，素有“駝鄉”之稱。這里出產的阿拉善雙峰駝以其體型大、絨質好等特點被確定為國家優良畜種，它具有耐粗飼、耐饑渴、耐高溫、耐嚴寒、耐負重、抗干旱、抗風沙、抗疾病等特殊能力。

最近國內大學研究者們攜手國內生物信息學專家們在Nature Communication上發表文章¹，報道完成了野生雙峰駝2.01Gb的基因組草圖，并揭示了野生雙峰駝能在極其嚴酷的環境下生存的秘密。利用454 GS FLX測序系統及短平臺進行了混合拼接，得到了120,352條scaffold，其中13,544條scaffold超過1 kb，3,453條scaffold超過10 kb，大于1kb的scaffold N50達到了2 Mb。預測編碼基因20821個，平均含8個外顯子，平均編碼區長1322 bp，編碼區GC含量達52%，顯著高于全基因組GC含量41%。

通過對編碼基因的考察，研究人員們發現雙峰駝的代謝通路調節方面的基因快速進化，因此在食物消化后的吸收與常規反芻動物完全不同。另外，雙峰駝可承受大量血糖也與部分基因改變有關，而這些基因正是與人類II型糖尿病相關的基因。對這些基因進一步的研究可能幫忙解開人體中胰島素調節以及糖尿病發生機制。在人體中中CYP2J基因控制高血壓，然而雙峰駝體內含有多個該基因的拷貝，使其即使在吃了大量鹽的情況下仍能保持較低的血壓。

1. Jirimutu. et al. Genome sequences of wild and domestic bactrian camels. Nat. Commun. 3:1202 doi: 10.1038/ncomms2192 (2012).

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