Fluidigm公司今天宣稱Fluidigm 和 SABiosciences(QIAGEN的子公司)共同合作開發了能夠在Fluidigm的BioMark系統上利用real-time PCR分析100多個通路基因表達的芯片。
此次聯手標志著Fluidigm第一次直接與另一銷售商共同合作優化基于微流體平臺的基因表達芯片,并期望能夠為用戶的研究提供一個定制的或預制的基因表達芯片。
對SABiosciences來說,公司表示該次合作主要是期望能夠在那些對BioMark系統所提供的高通量檢測水平有需求的制藥和生物技術研究者當中挖掘到新的客戶。
在達成協議之下,SABiosciencs將會繼續開發用于Fluidigm動態芯片的PCR 試劑盒。而該Fluidigm動態芯片利用微流體技術在BioMark系統中運行和分析。
公司表示, 一旦Fluidigm公司通過了優化芯片的內部測試,兩家公司的銷售隊伍將會把該產品以RT Profiler PCR Arrays形式向市場推廣。
每一個試劑盒包含了一定使用次數的試劑、合成一鏈cDNA的引物和足夠用來進行5塊96.96動態芯片反應的試劑。這個試劑盒將以96孔板的形式出現,這非常便于使用者快速建立96.96或48.48的反應體系。
SABiosciences的 real-time PCR Arrays包含一組與通路或疾病相關的96個基因的qPCR反應試劑盒,以及一些控制元件,如用于校準數據的管家基因,基因組DNA檢測引物以監控基因組DNA污染情況,反轉錄控制和PCR陽性控制等來檢測PCR反應的效率。
該試劑盒同樣為從新鮮的或冷凍的細胞和組織、小樣品、福爾馬林固定、石蠟包埋的樣品中提取RNA做了優化;
Lisa Isailovic,Fluidigm基因表達產品經理表示,此次合作是Fluidigm將BioMark作為一個開放的平臺的來發展的期望相一致。
“這是我們從銷售商獲得第一批用于測試的芯片,”Isailovic說。“使用BioMark平臺的人們現在可以向SABiosciences訂購預制的檢測96個不同基因的芯片,或者要求定制。”
另外Isailovic還說BioMark的客戶可以使用來自于其他銷售商的基因表達芯片和試劑盒,但他們并不能夠保證這些產品能夠在動態芯片上達到最佳的效果,相較于384孔板,動態芯片一次能夠獲得9216個定量數據,并節省200倍左右的試劑。
“我們為客戶提供越完善的平臺,客戶將會獲得越好的服務,”Fluidigm發言人Howard High告訴PCR業者。“用戶們知道使用Fluidigm的平臺能夠為他們提供非常棒的工作流程,既節省時間也節省成本。”不管怎么說,他們不一定有時間和技能去設計像Fluidigm公司所提供的這種微流體技術所創造的高通量檢測芯片。
Isailovic說降低在反應中試劑的用量是BioMark的一大優化亮點,但SABiosciences公司同樣對工作流程做了些變動,這仍需Fluidigm去檢測驗證是否可行。
另外,對Jeff Hung,SABiosciences的高級市場經理來說,關鍵的部分就是如何在整個工作流程中,將來自少量樣品的mRNA通過預擴增環節使之達到可被檢測的數量這一步驟整合進去。
Howard High說兩個公司的銷售團隊都將提供這一完整的優化試劑盒。Isailovic還說關于Fluidigm是否會影響SABiosciences 的母公司 Qiagen全球的銷售力,這是非常明顯的,因為關于QIAGEN的銷售網絡將會如何加入到這個合作關系的談話已經開始了。
Howard High說“隨著合作的深入,我們期待看到更多SABiosciences為Fluidigm平臺優化所作的貢獻。”然而他并沒繼續細說下去。
在SABiosciences之前,BioMark系統計劃將PCR反應芯片優化使之能在一系列相對復雜的儀器上使用。從SABioscience的網頁上可以看到,這些包括來自Life Technologies的 Applied Biosystems 團隊的RT-PCR平臺;Bio-Rad;Eppendorf; Roche; Agilent的 Stratagene unit; Takara。很快,該芯片將可以在Qiagen的 Rotor-Gene Q上使用。
Qiagen在12月份以9千萬美金收購了SABiosciences,作為PCR芯片的生產線。該公司宣稱這些分析試劑盒將用于生物醫藥研究和未來藥物的開發,將會為Qiagen在藥物和診斷學上的策略創造重大價值。(請看 PCR Insider 11/17/2009 和 GenomeWeb Daily News 9/23/09).
目前,SABiosciences PCR試劑盒的用戶主要是活躍于學術界,Qiagen期望這個新的子公司將在今年帶來將近2.4千萬美元的收入。
但這次與Fluidigm的合作同樣希望能夠從那些使用Biomark平臺以獲取高通量和降低試劑用量的研究者中為SABiosciences開發出新的市場。
“使用Fluidigm平臺的用戶跟我們平常的客戶是不同的,因為他們會在同一時間分析很多的樣品,”Shankar Sellappan,SABiosciences PCR試劑盒產品經理說。同時,這些客戶主要是在制藥和生物技術公司和核心實驗室里面,或者是進行一些專門的研究,如干細胞研究。
新聞來源:http://www.fluidigm.com/pr/2010/2010_03_24%20-%20PressRelease.htm
http://www.genomeweb.com/arrays/fluidigm-qiagen-develop-gene-expression-panels