研究人員借助羅氏454測序系統破譯南極冰層宏基因組
瀏覽次數:3475 發布日期:2009-7-16
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研究人員借助454測序系統破譯南極冰層宏基因組以探索氣候變化影響
多年來,位于德國 Bremerhaven的Alfred Wegener極地與海洋研究所(AWI)的研究人員一直在研究極地和海洋環境,以加強我們對海洋-冰-大氣交互作用以及北極和南極的動植物王國的了解。現在,AWI 的研究人員在Klaus Valentin 和他的同事— 來自東英格利亞大學的Thomas Mock 的牽頭下,宣布他們計劃對生活在北極海冰里的多種多樣的生物進行首次宏基因組學分析。他們準備采用在由羅氏旗下的 454生命科學公司舉辦的10 GB(Gigabase)免費測序項目中獲得的亞軍獎項的資助下來完成該項目。宏基因組測序能幫助研究人員詳細地查看某個復雜樣本里的種系組成和功能多樣性,近年來454測序系統已啟用了其中大部分的序列。
Alfred Wegener 研究所和東英格利亞大學在之前實施的項目中已完成了對海洋冰藻和細菌的基因組測序。此外,他們還測序了海冰物種及群落的轉錄組— 這些研究的目標是破譯促使這些物種在基因上適應南極極端環境的活性基因。作為此項新的宏基因組學研究的一部分,研究人員準備對北極冰層中發現的一整套微生物進行分析,希望找到這些微生物中未開啟的基因。
Valentin 說:“為了解基因組中仍在沉睡的基因,我們將同時對活性和惰性基因進行測序。如果諸如氣溫、二氧化碳濃度或光照強度等環境因素在未來發生變化,那么了解極地生物群落具備哪些基因潛力來對抗氣候變化是很重要的。”
過去幾十年來,氣候變化已對北極的生態系統造成了巨大的影響,包括海冰、森林和凍原。隨著北極氣溫的升高,棲息在北極地區的植物、動物和細菌種群要么被迫適應環境的變化,要么只能走向毀滅。
羅氏454生命科學公司的總裁兼CEO Chris McLeod說:“我們很高興看到454測序技術被應用于極地生物群落研究的重要領域。他們的研究結果將有助于更好地了解全球氣候變暖對兩極地區的影響。”
【關于羅氏】
羅氏始創于1896年,總部位于瑞士巴塞爾,在制藥和診斷領域是世界領先的以研發為基礎的健康事業公司之一。作為世界上最大的生物科技公司,羅氏提供從早期發現、預防、診斷到治療的創新產品與服務,在諸多領域都做出了突出的貢獻,從而提高了人類的健康水準和生活質量。羅氏是體外診斷領域、抗腫瘤藥品和移植藥品的全球領先者,是病毒學領域的市場領導者。在其它關鍵疾病領域如自身免疫性疾病、炎癥、代謝和中樞神經系統疾病等同樣表現活躍。2008年,藥品部的銷售額達360億瑞士法郎,診斷部的銷售額達97億瑞士法郎。2008年,羅氏在研發方面的投入超過了90億瑞士法郎,并與多個合作伙伴建立了研究與開發的業務聯盟,包括羅氏控股的基因泰克和中外制藥。羅氏集團共擁有約8萬名員工。如需了解更詳細的信息,請訪問www.roche-applied-science.com。
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