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賽默飛世爾在人類蛋白質組大會發布Proteome Dynamics

瀏覽次數:3257 發布日期:2008-8-22  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
世界領先的賽默飛世爾科技在2008年人類蛋白質組大會(HUPO 2008)上推出新的蛋白質組學工作流程解決方案,以及兩個Thermo Scientific軟件升級包。不久前推出的Proteome Discoverer 軟件平臺是一個綜合性的、可拓展軟件平臺,可以對蛋白質組的數據進行定性和定量分析,作為Proteome Discoverer 的補充,新加入的部分將進一步升級Thermo Scientific Proteome Dynamics。

Proteome Dynamics是一套完整的蛋白質組解決方案,包括試劑,樣品制備試劑盒和操作流程,質譜儀和具有特定功能的生物軟件,以方便識別,定量和定性鑒定蛋白質。推出新品包括以下幾個方面:

•自動化的磷酸化肽段工作流程—一套完整可自動化分析磷酸化肽段的操作流程
•SIEVE™ 1.2---主要對軟件中無標記差異分析部分進行升級。基于液相色譜質譜數據比較對蛋白和肽段的變化進行衡量和鑒定
•ProSightPC™ 2.0—拓展了業界領先的自上而下的鑒定能力,支持所有高質量準確度的串聯質譜實驗的蛋白鑒定和表征

在過去的十年里,蛋白質組學領域大步發展,它對生物和醫藥領域的尖端科技產生了深遠的影響。

Thermo Fisher一直致力于蛋白質組科學的發展,打破了傳統定性蛋白質組分析,轉向更高級的定量蛋白質組,因而創造了蛋白質組動態研究藍圖。

新型自動化磷酸化肽段分析流程將Thermo Scientific技術與Pierce®磷酸化肽段富集試劑盒、Kingfisher® Flex 磁珠純化系統和LTQ Orbitrap™ XL ETD 雜交質譜儀結合起來,可以完全實現對磷酸化肽段進行分析。致力于構建信號途徑的科學家會發現固定化金屬和金屬氧化物的親和色譜能夠富集磷酸化肽段,然后用質譜對其分析是一個功能強大的技術。然而,樣品的復雜度和低通量制備步驟成為一個主要的障礙。新型Thermo Scientific的整合操作流程對這類難題提供了一個簡單、有效的解決方案。“樣品制備和分析過程的每一部都是經過優化的。”Thermo Fisher Scientific 蛋白質學市場總監Andreas Huhmer說,“該工作流程可以使科學家實現整個過程無縫連接。

在2008年的人類蛋白質組大會上發布的另一款軟件是Thermo Scientific 的SIEVE 1.2。通過比較“健康”或對照組和“疾病”或處理不需要同位素標記的樣品的液相色譜質譜數據組,SIEVE可自動對無標記的蛋白和肽段進行差異分析。之前,研究者只能比較成對的數據。然而,在生物標志物發現的研究領域內,觀察數據趨勢是必須的,SIEVE 1.2 可以實現在單個趨勢分析中觀察多時間點和劑量點。

“SIEVE第一次發布后,我們從客戶收到反饋的主要問題是SIEVE如何根據時間不同監控蛋白變化,如何更方便的在肽段和蛋白水平上解釋其統計結果。”Thermo Fisher Scientific 蛋白質學市場程序經理Amy Zumwalt說,“為了滿足這一需求,我們在這個版本中加入了趨勢分析功能,并且完全重新構建了用戶界面。新的向導界面將使差異實驗結果和解釋統計結果變得更容易。”

同樣首次發布的軟件還有Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0,它最初是設計來方便“自上而下”(top-down)蛋白質定性鑒定。而現在可以支持所有高質量精度、高分辨率的串聯質譜蛋白實驗。

ProSightPC 2.0可以實現對高質量精度的二級質譜數據進行高通量分析,無論其來自是“自上而下”(top-down),“自中而下”(middle-down),還是“自下而上”(bottom-up)的實驗,而且可表征已知的翻譯后修飾蛋白(PTM)。“Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0是專門面向雜交質譜技術的,現在也可以支持新型LTQ Orbitrap XL ETD質譜的數據。”Andreas Huhmer說,“這給研究人員提供了獨一無二的工具,可以對蛋白異構體和變異體的錯綜復雜的差異進行分析。

SIEVE采用一種新型圖形界面,更易使用,而且重要的是它現在可以對液相色譜質譜的數據文件自動進行分析。而以前在處理數據之前必須手動挑選峰。而現在選擇整個色譜圖就可以對所有的峰進行自動分析了。

如需對Proteome Dynamics了解更多信息,請于2008年8月16日至20日訪問阿姆斯特丹的HUPO #34展臺,或致電800-810-5118或400-650-5118,電郵analyze.cn@thermofisher.com 或者訪問 www.thermo.com/orbitrap。

Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific的一部分,是全球科學服務領域的領導者

關于賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)
Thermo Fisher Scientific(賽默飛世爾科技)(紐約證交所代碼:TMO)是全球科學服務領域的領導者,致力于幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年銷售額超過100億美元,擁有員工約33,000人,在全球范圍內服務超過350,000家客戶。主要客戶類型包括:醫藥和生物公司,醫院和臨床診斷實驗室,大學、科研院所和政府機構,以及環境與工業過程控制裝備制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific這兩個主要的品牌,幫助客戶解決在分析化學領域從常規的測試到復雜的研發項目中所遇到的各種挑戰。Thermo Scientific能夠為客戶提供一整套包括高端分析儀器、實驗室裝備、軟件、服務、耗材和試劑在內的實驗室綜合解決方案。Fisher Scientific為衛生保健,科學研究,以及安全和教育領域的客戶提供一系列的實驗室裝備、化學藥品以及其他用品和服務。賽默飛世爾科技將努力為客戶提供最為便捷的采購方案,為科研的飛速發展不斷地改進工藝技術,提升客戶價值,幫助股東提高收益,為員工創造良好的發展空間。欲了解更多信息,請登陸: www.thermofisher.com


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